Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPE2

NGRN, Neugrin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NGRNQ9NPE2 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NGRNQ9NPE2 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NGRNQ9NPE2 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NGRNQ9NPE2 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NGRNQ9NPE2 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NGRNQ9NPE2 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NGRNQ9NPE2 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NGRNQ9NPE2 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NGRNQ9NPE2 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NGRNQ9NPE2 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NGRNQ9NPE2 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NGRNQ9NPE2 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
NGRNQ9NPE2 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.79
NGRNQ9NPE2 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NGRNQ9NPE2 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
NGRNQ9NPE2 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
NGRNQ9NPE2 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NGRNQ9NPE2 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NGRNQ9NPE2 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NGRNQ9NPE2 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NGRNQ9NPE2 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NGRNQ9NPE2 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NGRNQ9NPE2 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NGRNQ9NPE2 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NGRNQ9NPE2 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NGRNQ9NPE2 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NGRNQ9NPE2 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NGRNQ9NPE2 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NGRNQ9NPE2 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NGRNQ9NPE2 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NGRNQ9NPE2 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NGRNQ9NPE2 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NGRNQ9NPE2 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NGRNQ9NPE2 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
NGRNQ9NPE2 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NGRNQ9NPE2 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NGRNQ9NPE2 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NGRNQ9NPE2 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NGRNQ9NPE2 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NGRNQ9NPE2 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
NGRNQ9NPE2 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
NGRNQ9NPE2 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
NGRNQ9NPE2 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NGRNQ9NPE2 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NGRNQ9NPE2 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NGRNQ9NPE2 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NGRNQ9NPE2 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NGRNQ9NPE2 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NGRNQ9NPE2 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NGRNQ9NPE2 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NGRNQ9NPE2 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NGRNQ9NPE2 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NGRNQ9NPE2 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NGRNQ9NPE2 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
NGRNQ9NPE2 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
NGRNQ9NPE2 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
NGRNQ9NPE2 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
NGRNQ9NPE2 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NGRNQ9NPE2 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NGRNQ9NPE2 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NGRNQ9NPE2 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
NGRNQ9NPE2 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NGRNQ9NPE2 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NGRNQ9NPE2 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NGRNQ9NPE2 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NGRNQ9NPE2 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NGRNQ9NPE2 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NGRNQ9NPE2 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NGRNQ9NPE2 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NGRNQ9NPE2 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NGRNQ9NPE2 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NGRNQ9NPE2 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
NGRNQ9NPE2 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NGRNQ9NPE2 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NGRNQ9NPE2 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NGRNQ9NPE2 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NGRNQ9NPE2 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NGRNQ9NPE2 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NGRNQ9NPE2 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NGRNQ9NPE2 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NGRNQ9NPE2 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NGRNQ9NPE2 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NGRNQ9NPE2 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NGRNQ9NPE2 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NGRNQ9NPE2 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NGRNQ9NPE2 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
NGRNQ9NPE2 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NGRNQ9NPE2 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NGRNQ9NPE2 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NGRNQ9NPE2 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NGRNQ9NPE2 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NGRNQ9NPE2 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NGRNQ9NPE2 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NGRNQ9NPE2 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NGRNQ9NPE2 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NGRNQ9NPE2 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NGRNQ9NPE2 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NGRNQ9NPE2 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NGRNQ9NPE2 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NGRNQ9NPE2 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms