Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC4

A4GALT, Lactosylceramide 4-alpha-galactosyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4GALTQ9NPC4 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
A4GALTQ9NPC4 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
A4GALTQ9NPC4 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
A4GALTQ9NPC4 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
A4GALTQ9NPC4 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
A4GALTQ9NPC4 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
A4GALTQ9NPC4 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
A4GALTQ9NPC4 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
A4GALTQ9NPC4 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
A4GALTQ9NPC4 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
A4GALTQ9NPC4 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
A4GALTQ9NPC4 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
A4GALTQ9NPC4 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
A4GALTQ9NPC4 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
A4GALTQ9NPC4 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
A4GALTQ9NPC4 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
A4GALTQ9NPC4 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
A4GALTQ9NPC4 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
A4GALTQ9NPC4 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
A4GALTQ9NPC4 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
A4GALTQ9NPC4 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
A4GALTQ9NPC4 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
A4GALTQ9NPC4 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
A4GALTQ9NPC4 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
A4GALTQ9NPC4 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
A4GALTQ9NPC4 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
A4GALTQ9NPC4 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
A4GALTQ9NPC4 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
A4GALTQ9NPC4 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
A4GALTQ9NPC4 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
A4GALTQ9NPC4 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
A4GALTQ9NPC4 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
A4GALTQ9NPC4 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
A4GALTQ9NPC4 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
A4GALTQ9NPC4 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
A4GALTQ9NPC4 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
A4GALTQ9NPC4 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
A4GALTQ9NPC4 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
A4GALTQ9NPC4 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
A4GALTQ9NPC4 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
A4GALTQ9NPC4 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.19
A4GALTQ9NPC4 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
A4GALTQ9NPC4 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
A4GALTQ9NPC4 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
A4GALTQ9NPC4 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
A4GALTQ9NPC4 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
A4GALTQ9NPC4 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
A4GALTQ9NPC4 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
A4GALTQ9NPC4 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
A4GALTQ9NPC4 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
A4GALTQ9NPC4 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
A4GALTQ9NPC4 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
A4GALTQ9NPC4 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
A4GALTQ9NPC4 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
A4GALTQ9NPC4 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
A4GALTQ9NPC4 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
A4GALTQ9NPC4 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
A4GALTQ9NPC4 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
A4GALTQ9NPC4 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
A4GALTQ9NPC4 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
A4GALTQ9NPC4 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
A4GALTQ9NPC4 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
A4GALTQ9NPC4 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
A4GALTQ9NPC4 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
A4GALTQ9NPC4 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
A4GALTQ9NPC4 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
A4GALTQ9NPC4 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
A4GALTQ9NPC4 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
A4GALTQ9NPC4 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
A4GALTQ9NPC4 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
A4GALTQ9NPC4 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
A4GALTQ9NPC4 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
A4GALTQ9NPC4 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
A4GALTQ9NPC4 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
A4GALTQ9NPC4 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
A4GALTQ9NPC4 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
A4GALTQ9NPC4 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
A4GALTQ9NPC4 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
A4GALTQ9NPC4 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
A4GALTQ9NPC4 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
A4GALTQ9NPC4 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
A4GALTQ9NPC4 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
A4GALTQ9NPC4 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
A4GALTQ9NPC4 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
A4GALTQ9NPC4 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
A4GALTQ9NPC4 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
A4GALTQ9NPC4 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
A4GALTQ9NPC4 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
A4GALTQ9NPC4 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
A4GALTQ9NPC4 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
A4GALTQ9NPC4 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
A4GALTQ9NPC4 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
A4GALTQ9NPC4 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
A4GALTQ9NPC4 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
A4GALTQ9NPC4 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
A4GALTQ9NPC4 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
A4GALTQ9NPC4 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
A4GALTQ9NPC4 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
A4GALTQ9NPC4 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
A4GALTQ9NPC4 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms