Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD45

TM9SF3, Transmembrane 9 superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM9SF3Q9HD45 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TM9SF3Q9HD45 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TM9SF3Q9HD45 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TM9SF3Q9HD45 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TM9SF3Q9HD45 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TM9SF3Q9HD45 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TM9SF3Q9HD45 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TM9SF3Q9HD45 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TM9SF3Q9HD45 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TM9SF3Q9HD45 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TM9SF3Q9HD45 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TM9SF3Q9HD45 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TM9SF3Q9HD45 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TM9SF3Q9HD45 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TM9SF3Q9HD45 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TM9SF3Q9HD45 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TM9SF3Q9HD45 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TM9SF3Q9HD45 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TM9SF3Q9HD45 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TM9SF3Q9HD45 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TM9SF3Q9HD45 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TM9SF3Q9HD45 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TM9SF3Q9HD45 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TM9SF3Q9HD45 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.47
TM9SF3Q9HD45 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TM9SF3Q9HD45 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TM9SF3Q9HD45 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TM9SF3Q9HD45 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TM9SF3Q9HD45 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TM9SF3Q9HD45 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TM9SF3Q9HD45 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TM9SF3Q9HD45 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TM9SF3Q9HD45 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TM9SF3Q9HD45 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TM9SF3Q9HD45 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TM9SF3Q9HD45 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TM9SF3Q9HD45 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TM9SF3Q9HD45 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TM9SF3Q9HD45 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TM9SF3Q9HD45 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TM9SF3Q9HD45 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TM9SF3Q9HD45 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TM9SF3Q9HD45 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TM9SF3Q9HD45 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TM9SF3Q9HD45 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TM9SF3Q9HD45 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TM9SF3Q9HD45 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TM9SF3Q9HD45 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TM9SF3Q9HD45 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TM9SF3Q9HD45 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TM9SF3Q9HD45 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TM9SF3Q9HD45 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TM9SF3Q9HD45 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TM9SF3Q9HD45 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
TM9SF3Q9HD45 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
TM9SF3Q9HD45 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TM9SF3Q9HD45 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TM9SF3Q9HD45 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TM9SF3Q9HD45 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TM9SF3Q9HD45 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TM9SF3Q9HD45 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TM9SF3Q9HD45 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TM9SF3Q9HD45 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TM9SF3Q9HD45 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TM9SF3Q9HD45 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TM9SF3Q9HD45 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TM9SF3Q9HD45 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TM9SF3Q9HD45 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TM9SF3Q9HD45 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TM9SF3Q9HD45 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TM9SF3Q9HD45 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TM9SF3Q9HD45 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TM9SF3Q9HD45 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TM9SF3Q9HD45 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TM9SF3Q9HD45 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TM9SF3Q9HD45 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TM9SF3Q9HD45 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TM9SF3Q9HD45 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TM9SF3Q9HD45 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TM9SF3Q9HD45 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TM9SF3Q9HD45 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TM9SF3Q9HD45 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TM9SF3Q9HD45 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TM9SF3Q9HD45 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TM9SF3Q9HD45 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TM9SF3Q9HD45 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TM9SF3Q9HD45 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TM9SF3Q9HD45 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TM9SF3Q9HD45 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TM9SF3Q9HD45 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TM9SF3Q9HD45 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TM9SF3Q9HD45 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TM9SF3Q9HD45 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TM9SF3Q9HD45 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TM9SF3Q9HD45 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TM9SF3Q9HD45 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TM9SF3Q9HD45 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TM9SF3Q9HD45 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TM9SF3Q9HD45 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TM9SF3Q9HD45 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms