Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCX3

ZNF304, Zinc finger protein 304, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF304Q9HCX3 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF304Q9HCX3 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF304Q9HCX3 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF304Q9HCX3 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF304Q9HCX3 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF304Q9HCX3 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF304Q9HCX3 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF304Q9HCX3 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF304Q9HCX3 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF304Q9HCX3 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF304Q9HCX3 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF304Q9HCX3 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF304Q9HCX3 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF304Q9HCX3 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF304Q9HCX3 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF304Q9HCX3 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF304Q9HCX3 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF304Q9HCX3 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF304Q9HCX3 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF304Q9HCX3 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF304Q9HCX3 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF304Q9HCX3 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF304Q9HCX3 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF304Q9HCX3 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF304Q9HCX3 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF304Q9HCX3 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF304Q9HCX3 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF304Q9HCX3 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF304Q9HCX3 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF304Q9HCX3 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF304Q9HCX3 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF304Q9HCX3 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF304Q9HCX3 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF304Q9HCX3 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF304Q9HCX3 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF304Q9HCX3 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF304Q9HCX3 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ZNF304Q9HCX3 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNF304Q9HCX3 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNF304Q9HCX3 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNF304Q9HCX3 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNF304Q9HCX3 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF304Q9HCX3 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF304Q9HCX3 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF304Q9HCX3 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF304Q9HCX3 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF304Q9HCX3 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF304Q9HCX3 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF304Q9HCX3 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF304Q9HCX3 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF304Q9HCX3 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF304Q9HCX3 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF304Q9HCX3 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF304Q9HCX3 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF304Q9HCX3 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF304Q9HCX3 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF304Q9HCX3 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF304Q9HCX3 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF304Q9HCX3 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF304Q9HCX3 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF304Q9HCX3 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF304Q9HCX3 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF304Q9HCX3 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF304Q9HCX3 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF304Q9HCX3 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF304Q9HCX3 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF304Q9HCX3 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF304Q9HCX3 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF304Q9HCX3 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF304Q9HCX3 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF304Q9HCX3 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF304Q9HCX3 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF304Q9HCX3 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF304Q9HCX3 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF304Q9HCX3 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF304Q9HCX3 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ZNF304Q9HCX3 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF304Q9HCX3 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF304Q9HCX3 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF304Q9HCX3 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF304Q9HCX3 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF304Q9HCX3 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF304Q9HCX3 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF304Q9HCX3 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF304Q9HCX3 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF304Q9HCX3 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF304Q9HCX3 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF304Q9HCX3 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF304Q9HCX3 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF304Q9HCX3 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF304Q9HCX3 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF304Q9HCX3 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF304Q9HCX3 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF304Q9HCX3 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF304Q9HCX3 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF304Q9HCX3 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF304Q9HCX3 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF304Q9HCX3 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF304Q9HCX3 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF304Q9HCX3 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms