Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCJ6

VAT1L, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog-like, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1LQ9HCJ6 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
VAT1LQ9HCJ6 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
VAT1LQ9HCJ6 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
VAT1LQ9HCJ6 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
VAT1LQ9HCJ6 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
VAT1LQ9HCJ6 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
VAT1LQ9HCJ6 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
VAT1LQ9HCJ6 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
VAT1LQ9HCJ6 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
VAT1LQ9HCJ6 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
VAT1LQ9HCJ6 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
VAT1LQ9HCJ6 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
VAT1LQ9HCJ6 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
VAT1LQ9HCJ6 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
VAT1LQ9HCJ6 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
VAT1LQ9HCJ6 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
VAT1LQ9HCJ6 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
VAT1LQ9HCJ6 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
VAT1LQ9HCJ6 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
VAT1LQ9HCJ6 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
VAT1LQ9HCJ6 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
VAT1LQ9HCJ6 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
VAT1LQ9HCJ6 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
VAT1LQ9HCJ6 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
VAT1LQ9HCJ6 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
VAT1LQ9HCJ6 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
VAT1LQ9HCJ6 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
VAT1LQ9HCJ6 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
VAT1LQ9HCJ6 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
VAT1LQ9HCJ6 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
VAT1LQ9HCJ6 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
VAT1LQ9HCJ6 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
VAT1LQ9HCJ6 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
VAT1LQ9HCJ6 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
VAT1LQ9HCJ6 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
VAT1LQ9HCJ6 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
VAT1LQ9HCJ6 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
VAT1LQ9HCJ6 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
VAT1LQ9HCJ6 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
VAT1LQ9HCJ6 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
VAT1LQ9HCJ6 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
VAT1LQ9HCJ6 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
VAT1LQ9HCJ6 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
VAT1LQ9HCJ6 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
VAT1LQ9HCJ6 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
VAT1LQ9HCJ6 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
VAT1LQ9HCJ6 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
VAT1LQ9HCJ6 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
VAT1LQ9HCJ6 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
VAT1LQ9HCJ6 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
VAT1LQ9HCJ6 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
VAT1LQ9HCJ6 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
VAT1LQ9HCJ6 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
VAT1LQ9HCJ6 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
VAT1LQ9HCJ6 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
VAT1LQ9HCJ6 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
VAT1LQ9HCJ6 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
VAT1LQ9HCJ6 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
VAT1LQ9HCJ6 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
VAT1LQ9HCJ6 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
VAT1LQ9HCJ6 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
VAT1LQ9HCJ6 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
VAT1LQ9HCJ6 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
VAT1LQ9HCJ6 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
VAT1LQ9HCJ6 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
VAT1LQ9HCJ6 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
VAT1LQ9HCJ6 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
VAT1LQ9HCJ6 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
VAT1LQ9HCJ6 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
VAT1LQ9HCJ6 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
VAT1LQ9HCJ6 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
VAT1LQ9HCJ6 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
VAT1LQ9HCJ6 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
VAT1LQ9HCJ6 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
VAT1LQ9HCJ6 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
VAT1LQ9HCJ6 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC28■■■□□ 2.07
VAT1LQ9HCJ6 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
VAT1LQ9HCJ6 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
VAT1LQ9HCJ6 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
VAT1LQ9HCJ6 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
VAT1LQ9HCJ6 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
VAT1LQ9HCJ6 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
VAT1LQ9HCJ6 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
VAT1LQ9HCJ6 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
VAT1LQ9HCJ6 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
VAT1LQ9HCJ6 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
VAT1LQ9HCJ6 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
VAT1LQ9HCJ6 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
VAT1LQ9HCJ6 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
VAT1LQ9HCJ6 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
VAT1LQ9HCJ6 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
VAT1LQ9HCJ6 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
VAT1LQ9HCJ6 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
VAT1LQ9HCJ6 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
VAT1LQ9HCJ6 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
VAT1LQ9HCJ6 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
VAT1LQ9HCJ6 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
VAT1LQ9HCJ6 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
VAT1LQ9HCJ6 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
VAT1LQ9HCJ6 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.1 ms