Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC77

CENPJ, Centromere protein J, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPJQ9HC77 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
CENPJQ9HC77 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
CENPJQ9HC77 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
CENPJQ9HC77 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
CENPJQ9HC77 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
CENPJQ9HC77 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
CENPJQ9HC77 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
CENPJQ9HC77 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
CENPJQ9HC77 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
CENPJQ9HC77 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
CENPJQ9HC77 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC34.07■■■■□ 3.05
CENPJQ9HC77 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
CENPJQ9HC77 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
CENPJQ9HC77 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
CENPJQ9HC77 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
CENPJQ9HC77 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
CENPJQ9HC77 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
CENPJQ9HC77 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
CENPJQ9HC77 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
CENPJQ9HC77 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
CENPJQ9HC77 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC34.04■■■■□ 3.04
CENPJQ9HC77 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
CENPJQ9HC77 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
CENPJQ9HC77 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
CENPJQ9HC77 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC34.03■■■■□ 3.04
CENPJQ9HC77 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
CENPJQ9HC77 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
CENPJQ9HC77 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
CENPJQ9HC77 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
CENPJQ9HC77 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
CENPJQ9HC77 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
CENPJQ9HC77 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC34.01■■■■□ 3.04
CENPJQ9HC77 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC34.01■■■■□ 3.03
CENPJQ9HC77 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
CENPJQ9HC77 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
CENPJQ9HC77 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
CENPJQ9HC77 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
CENPJQ9HC77 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
CENPJQ9HC77 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
CENPJQ9HC77 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC34■■■■□ 3.03
CENPJQ9HC77 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
CENPJQ9HC77 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
CENPJQ9HC77 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
CENPJQ9HC77 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC33.99■■■■□ 3.03
CENPJQ9HC77 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
CENPJQ9HC77 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
CENPJQ9HC77 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
CENPJQ9HC77 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
CENPJQ9HC77 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
CENPJQ9HC77 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
CENPJQ9HC77 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
CENPJQ9HC77 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
CENPJQ9HC77 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
CENPJQ9HC77 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
CENPJQ9HC77 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
CENPJQ9HC77 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
CENPJQ9HC77 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
CENPJQ9HC77 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC33.95■■■■□ 3.03
CENPJQ9HC77 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
CENPJQ9HC77 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
CENPJQ9HC77 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
CENPJQ9HC77 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
CENPJQ9HC77 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
CENPJQ9HC77 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC33.94■■■■□ 3.02
CENPJQ9HC77 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
CENPJQ9HC77 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC33.94■■■■□ 3.02
CENPJQ9HC77 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
CENPJQ9HC77 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
CENPJQ9HC77 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
CENPJQ9HC77 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
CENPJQ9HC77 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
CENPJQ9HC77 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
CENPJQ9HC77 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
CENPJQ9HC77 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC33.91■■■■□ 3.02
CENPJQ9HC77 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
CENPJQ9HC77 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
CENPJQ9HC77 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
CENPJQ9HC77 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
CENPJQ9HC77 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
CENPJQ9HC77 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
CENPJQ9HC77 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
CENPJQ9HC77 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC33.87■■■■□ 3.01
CENPJQ9HC77 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC33.87■■■■□ 3.01
CENPJQ9HC77 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
CENPJQ9HC77 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
CENPJQ9HC77 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
CENPJQ9HC77 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
CENPJQ9HC77 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
CENPJQ9HC77 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
CENPJQ9HC77 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
CENPJQ9HC77 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
CENPJQ9HC77 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
CENPJQ9HC77 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
CENPJQ9HC77 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
CENPJQ9HC77 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
CENPJQ9HC77 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC33.83■■■■□ 3.01
CENPJQ9HC77 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
CENPJQ9HC77 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC33.82■■■■□ 3.01
CENPJQ9HC77 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
CENPJQ9HC77 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms