Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7U1

CCSER2, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Length 834 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSER2Q9H7U1 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCSER2Q9H7U1 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCSER2Q9H7U1 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCSER2Q9H7U1 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCSER2Q9H7U1 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCSER2Q9H7U1 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCSER2Q9H7U1 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCSER2Q9H7U1 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCSER2Q9H7U1 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CCSER2Q9H7U1 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CCSER2Q9H7U1 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCSER2Q9H7U1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCSER2Q9H7U1 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCSER2Q9H7U1 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CCSER2Q9H7U1 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCSER2Q9H7U1 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCSER2Q9H7U1 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCSER2Q9H7U1 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCSER2Q9H7U1 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCSER2Q9H7U1 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCSER2Q9H7U1 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCSER2Q9H7U1 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCSER2Q9H7U1 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCSER2Q9H7U1 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCSER2Q9H7U1 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCSER2Q9H7U1 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCSER2Q9H7U1 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCSER2Q9H7U1 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCSER2Q9H7U1 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCSER2Q9H7U1 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCSER2Q9H7U1 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCSER2Q9H7U1 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCSER2Q9H7U1 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCSER2Q9H7U1 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCSER2Q9H7U1 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCSER2Q9H7U1 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCSER2Q9H7U1 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCSER2Q9H7U1 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCSER2Q9H7U1 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCSER2Q9H7U1 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCSER2Q9H7U1 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCSER2Q9H7U1 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCSER2Q9H7U1 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCSER2Q9H7U1 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCSER2Q9H7U1 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCSER2Q9H7U1 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCSER2Q9H7U1 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCSER2Q9H7U1 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCSER2Q9H7U1 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CCSER2Q9H7U1 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCSER2Q9H7U1 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCSER2Q9H7U1 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCSER2Q9H7U1 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CCSER2Q9H7U1 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCSER2Q9H7U1 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCSER2Q9H7U1 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCSER2Q9H7U1 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCSER2Q9H7U1 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCSER2Q9H7U1 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CCSER2Q9H7U1 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCSER2Q9H7U1 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCSER2Q9H7U1 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCSER2Q9H7U1 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCSER2Q9H7U1 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCSER2Q9H7U1 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCSER2Q9H7U1 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCSER2Q9H7U1 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCSER2Q9H7U1 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCSER2Q9H7U1 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCSER2Q9H7U1 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCSER2Q9H7U1 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCSER2Q9H7U1 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCSER2Q9H7U1 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCSER2Q9H7U1 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCSER2Q9H7U1 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCSER2Q9H7U1 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CCSER2Q9H7U1 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CCSER2Q9H7U1 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCSER2Q9H7U1 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCSER2Q9H7U1 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCSER2Q9H7U1 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCSER2Q9H7U1 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCSER2Q9H7U1 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCSER2Q9H7U1 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCSER2Q9H7U1 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCSER2Q9H7U1 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCSER2Q9H7U1 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCSER2Q9H7U1 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCSER2Q9H7U1 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCSER2Q9H7U1 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCSER2Q9H7U1 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCSER2Q9H7U1 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CCSER2Q9H7U1 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCSER2Q9H7U1 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCSER2Q9H7U1 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCSER2Q9H7U1 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCSER2Q9H7U1 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCSER2Q9H7U1 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCSER2Q9H7U1 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCSER2Q9H7U1 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
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