Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6U6

BCAS3, Breast carcinoma-amplified sequence 3, humanhuman

Predictions only

Length 928 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCAS3Q9H6U6 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
BCAS3Q9H6U6 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
BCAS3Q9H6U6 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
BCAS3Q9H6U6 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
BCAS3Q9H6U6 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
BCAS3Q9H6U6 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
BCAS3Q9H6U6 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
BCAS3Q9H6U6 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
BCAS3Q9H6U6 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
BCAS3Q9H6U6 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
BCAS3Q9H6U6 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
BCAS3Q9H6U6 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
BCAS3Q9H6U6 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
BCAS3Q9H6U6 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
BCAS3Q9H6U6 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
BCAS3Q9H6U6 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
BCAS3Q9H6U6 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
BCAS3Q9H6U6 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
BCAS3Q9H6U6 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
BCAS3Q9H6U6 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
BCAS3Q9H6U6 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
BCAS3Q9H6U6 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
BCAS3Q9H6U6 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
BCAS3Q9H6U6 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
BCAS3Q9H6U6 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
BCAS3Q9H6U6 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
BCAS3Q9H6U6 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
BCAS3Q9H6U6 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
BCAS3Q9H6U6 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
BCAS3Q9H6U6 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
BCAS3Q9H6U6 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
BCAS3Q9H6U6 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
BCAS3Q9H6U6 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
BCAS3Q9H6U6 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
BCAS3Q9H6U6 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
BCAS3Q9H6U6 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
BCAS3Q9H6U6 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
BCAS3Q9H6U6 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
BCAS3Q9H6U6 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
BCAS3Q9H6U6 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
BCAS3Q9H6U6 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
BCAS3Q9H6U6 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.97
BCAS3Q9H6U6 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
BCAS3Q9H6U6 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
BCAS3Q9H6U6 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
BCAS3Q9H6U6 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
BCAS3Q9H6U6 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
BCAS3Q9H6U6 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
BCAS3Q9H6U6 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
BCAS3Q9H6U6 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
BCAS3Q9H6U6 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
BCAS3Q9H6U6 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
BCAS3Q9H6U6 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
BCAS3Q9H6U6 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
BCAS3Q9H6U6 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
BCAS3Q9H6U6 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
BCAS3Q9H6U6 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
BCAS3Q9H6U6 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
BCAS3Q9H6U6 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
BCAS3Q9H6U6 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
BCAS3Q9H6U6 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
BCAS3Q9H6U6 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
BCAS3Q9H6U6 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
BCAS3Q9H6U6 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
BCAS3Q9H6U6 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
BCAS3Q9H6U6 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
BCAS3Q9H6U6 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
BCAS3Q9H6U6 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
BCAS3Q9H6U6 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
BCAS3Q9H6U6 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
BCAS3Q9H6U6 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
BCAS3Q9H6U6 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
BCAS3Q9H6U6 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
BCAS3Q9H6U6 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
BCAS3Q9H6U6 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
BCAS3Q9H6U6 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
BCAS3Q9H6U6 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
BCAS3Q9H6U6 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
BCAS3Q9H6U6 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
BCAS3Q9H6U6 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
BCAS3Q9H6U6 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
BCAS3Q9H6U6 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
BCAS3Q9H6U6 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
BCAS3Q9H6U6 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
BCAS3Q9H6U6 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
BCAS3Q9H6U6 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
BCAS3Q9H6U6 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
BCAS3Q9H6U6 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
BCAS3Q9H6U6 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
BCAS3Q9H6U6 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
BCAS3Q9H6U6 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
BCAS3Q9H6U6 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
BCAS3Q9H6U6 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
BCAS3Q9H6U6 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
BCAS3Q9H6U6 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
BCAS3Q9H6U6 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
BCAS3Q9H6U6 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
BCAS3Q9H6U6 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
BCAS3Q9H6U6 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
BCAS3Q9H6U6 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms