Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6A9

PCNX3, Pecanex-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 2,034 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX3Q9H6A9 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCNX3Q9H6A9 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCNX3Q9H6A9 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PCNX3Q9H6A9 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCNX3Q9H6A9 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCNX3Q9H6A9 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCNX3Q9H6A9 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCNX3Q9H6A9 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PCNX3Q9H6A9 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PCNX3Q9H6A9 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCNX3Q9H6A9 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCNX3Q9H6A9 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PCNX3Q9H6A9 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCNX3Q9H6A9 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCNX3Q9H6A9 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCNX3Q9H6A9 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCNX3Q9H6A9 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCNX3Q9H6A9 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCNX3Q9H6A9 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCNX3Q9H6A9 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCNX3Q9H6A9 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCNX3Q9H6A9 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCNX3Q9H6A9 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PCNX3Q9H6A9 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCNX3Q9H6A9 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCNX3Q9H6A9 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCNX3Q9H6A9 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCNX3Q9H6A9 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCNX3Q9H6A9 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCNX3Q9H6A9 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCNX3Q9H6A9 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCNX3Q9H6A9 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCNX3Q9H6A9 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCNX3Q9H6A9 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCNX3Q9H6A9 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PCNX3Q9H6A9 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PCNX3Q9H6A9 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCNX3Q9H6A9 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCNX3Q9H6A9 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCNX3Q9H6A9 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCNX3Q9H6A9 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCNX3Q9H6A9 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCNX3Q9H6A9 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCNX3Q9H6A9 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCNX3Q9H6A9 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCNX3Q9H6A9 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCNX3Q9H6A9 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCNX3Q9H6A9 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCNX3Q9H6A9 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCNX3Q9H6A9 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCNX3Q9H6A9 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCNX3Q9H6A9 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PCNX3Q9H6A9 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCNX3Q9H6A9 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCNX3Q9H6A9 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCNX3Q9H6A9 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCNX3Q9H6A9 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCNX3Q9H6A9 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCNX3Q9H6A9 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PCNX3Q9H6A9 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCNX3Q9H6A9 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCNX3Q9H6A9 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCNX3Q9H6A9 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCNX3Q9H6A9 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCNX3Q9H6A9 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PCNX3Q9H6A9 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PCNX3Q9H6A9 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PCNX3Q9H6A9 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PCNX3Q9H6A9 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PCNX3Q9H6A9 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PCNX3Q9H6A9 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PCNX3Q9H6A9 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCNX3Q9H6A9 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCNX3Q9H6A9 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCNX3Q9H6A9 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCNX3Q9H6A9 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCNX3Q9H6A9 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCNX3Q9H6A9 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCNX3Q9H6A9 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PCNX3Q9H6A9 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCNX3Q9H6A9 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCNX3Q9H6A9 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCNX3Q9H6A9 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCNX3Q9H6A9 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCNX3Q9H6A9 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PCNX3Q9H6A9 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCNX3Q9H6A9 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCNX3Q9H6A9 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCNX3Q9H6A9 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCNX3Q9H6A9 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCNX3Q9H6A9 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCNX3Q9H6A9 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCNX3Q9H6A9 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCNX3Q9H6A9 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
PCNX3Q9H6A9 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PCNX3Q9H6A9 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PCNX3Q9H6A9 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PCNX3Q9H6A9 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PCNX3Q9H6A9 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PCNX3Q9H6A9 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms