Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4M3

FBXO44, F-box only protein 44, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO44Q9H4M3 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
FBXO44Q9H4M3 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
FBXO44Q9H4M3 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FBXO44Q9H4M3 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FBXO44Q9H4M3 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FBXO44Q9H4M3 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FBXO44Q9H4M3 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FBXO44Q9H4M3 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FBXO44Q9H4M3 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FBXO44Q9H4M3 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FBXO44Q9H4M3 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FBXO44Q9H4M3 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FBXO44Q9H4M3 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FBXO44Q9H4M3 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FBXO44Q9H4M3 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FBXO44Q9H4M3 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
FBXO44Q9H4M3 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
FBXO44Q9H4M3 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FBXO44Q9H4M3 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FBXO44Q9H4M3 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
FBXO44Q9H4M3 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
FBXO44Q9H4M3 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FBXO44Q9H4M3 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
FBXO44Q9H4M3 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
FBXO44Q9H4M3 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
FBXO44Q9H4M3 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
FBXO44Q9H4M3 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
FBXO44Q9H4M3 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FBXO44Q9H4M3 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
FBXO44Q9H4M3 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FBXO44Q9H4M3 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FBXO44Q9H4M3 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FBXO44Q9H4M3 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FBXO44Q9H4M3 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FBXO44Q9H4M3 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FBXO44Q9H4M3 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
FBXO44Q9H4M3 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FBXO44Q9H4M3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FBXO44Q9H4M3 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FBXO44Q9H4M3 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FBXO44Q9H4M3 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FBXO44Q9H4M3 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FBXO44Q9H4M3 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
FBXO44Q9H4M3 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
FBXO44Q9H4M3 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FBXO44Q9H4M3 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FBXO44Q9H4M3 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FBXO44Q9H4M3 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FBXO44Q9H4M3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FBXO44Q9H4M3 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FBXO44Q9H4M3 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FBXO44Q9H4M3 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FBXO44Q9H4M3 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FBXO44Q9H4M3 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FBXO44Q9H4M3 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FBXO44Q9H4M3 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FBXO44Q9H4M3 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FBXO44Q9H4M3 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FBXO44Q9H4M3 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FBXO44Q9H4M3 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FBXO44Q9H4M3 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FBXO44Q9H4M3 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FBXO44Q9H4M3 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FBXO44Q9H4M3 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FBXO44Q9H4M3 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FBXO44Q9H4M3 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FBXO44Q9H4M3 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FBXO44Q9H4M3 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FBXO44Q9H4M3 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FBXO44Q9H4M3 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FBXO44Q9H4M3 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
FBXO44Q9H4M3 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FBXO44Q9H4M3 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FBXO44Q9H4M3 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FBXO44Q9H4M3 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FBXO44Q9H4M3 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FBXO44Q9H4M3 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FBXO44Q9H4M3 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FBXO44Q9H4M3 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FBXO44Q9H4M3 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FBXO44Q9H4M3 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FBXO44Q9H4M3 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FBXO44Q9H4M3 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FBXO44Q9H4M3 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FBXO44Q9H4M3 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FBXO44Q9H4M3 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FBXO44Q9H4M3 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
FBXO44Q9H4M3 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FBXO44Q9H4M3 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FBXO44Q9H4M3 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FBXO44Q9H4M3 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
FBXO44Q9H4M3 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FBXO44Q9H4M3 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FBXO44Q9H4M3 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FBXO44Q9H4M3 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FBXO44Q9H4M3 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FBXO44Q9H4M3 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FBXO44Q9H4M3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FBXO44Q9H4M3 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FBXO44Q9H4M3 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.2 ms