Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3U5

MFSD1, Major facilitator superfamily domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFSD1Q9H3U5 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MFSD1Q9H3U5 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
MFSD1Q9H3U5 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MFSD1Q9H3U5 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MFSD1Q9H3U5 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MFSD1Q9H3U5 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MFSD1Q9H3U5 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MFSD1Q9H3U5 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MFSD1Q9H3U5 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MFSD1Q9H3U5 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MFSD1Q9H3U5 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
MFSD1Q9H3U5 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
MFSD1Q9H3U5 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MFSD1Q9H3U5 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MFSD1Q9H3U5 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MFSD1Q9H3U5 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MFSD1Q9H3U5 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MFSD1Q9H3U5 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MFSD1Q9H3U5 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MFSD1Q9H3U5 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MFSD1Q9H3U5 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MFSD1Q9H3U5 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MFSD1Q9H3U5 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MFSD1Q9H3U5 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MFSD1Q9H3U5 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MFSD1Q9H3U5 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MFSD1Q9H3U5 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MFSD1Q9H3U5 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MFSD1Q9H3U5 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MFSD1Q9H3U5 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MFSD1Q9H3U5 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MFSD1Q9H3U5 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MFSD1Q9H3U5 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
MFSD1Q9H3U5 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MFSD1Q9H3U5 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MFSD1Q9H3U5 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MFSD1Q9H3U5 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MFSD1Q9H3U5 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MFSD1Q9H3U5 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MFSD1Q9H3U5 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MFSD1Q9H3U5 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MFSD1Q9H3U5 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MFSD1Q9H3U5 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MFSD1Q9H3U5 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MFSD1Q9H3U5 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MFSD1Q9H3U5 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MFSD1Q9H3U5 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MFSD1Q9H3U5 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MFSD1Q9H3U5 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MFSD1Q9H3U5 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MFSD1Q9H3U5 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MFSD1Q9H3U5 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MFSD1Q9H3U5 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MFSD1Q9H3U5 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MFSD1Q9H3U5 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MFSD1Q9H3U5 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MFSD1Q9H3U5 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MFSD1Q9H3U5 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MFSD1Q9H3U5 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MFSD1Q9H3U5 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MFSD1Q9H3U5 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MFSD1Q9H3U5 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
MFSD1Q9H3U5 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MFSD1Q9H3U5 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MFSD1Q9H3U5 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MFSD1Q9H3U5 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MFSD1Q9H3U5 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MFSD1Q9H3U5 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MFSD1Q9H3U5 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MFSD1Q9H3U5 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MFSD1Q9H3U5 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MFSD1Q9H3U5 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MFSD1Q9H3U5 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MFSD1Q9H3U5 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MFSD1Q9H3U5 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MFSD1Q9H3U5 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MFSD1Q9H3U5 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MFSD1Q9H3U5 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MFSD1Q9H3U5 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
MFSD1Q9H3U5 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MFSD1Q9H3U5 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MFSD1Q9H3U5 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MFSD1Q9H3U5 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MFSD1Q9H3U5 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MFSD1Q9H3U5 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MFSD1Q9H3U5 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MFSD1Q9H3U5 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MFSD1Q9H3U5 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MFSD1Q9H3U5 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MFSD1Q9H3U5 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MFSD1Q9H3U5 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MFSD1Q9H3U5 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MFSD1Q9H3U5 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MFSD1Q9H3U5 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MFSD1Q9H3U5 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
MFSD1Q9H3U5 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MFSD1Q9H3U5 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MFSD1Q9H3U5 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MFSD1Q9H3U5 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MFSD1Q9H3U5 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms