Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2W2

MIXL1, Homeobox protein MIXL1, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIXL1Q9H2W2 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MIXL1Q9H2W2 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MIXL1Q9H2W2 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MIXL1Q9H2W2 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MIXL1Q9H2W2 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
MIXL1Q9H2W2 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MIXL1Q9H2W2 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MIXL1Q9H2W2 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MIXL1Q9H2W2 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MIXL1Q9H2W2 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MIXL1Q9H2W2 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MIXL1Q9H2W2 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MIXL1Q9H2W2 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MIXL1Q9H2W2 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MIXL1Q9H2W2 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MIXL1Q9H2W2 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MIXL1Q9H2W2 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MIXL1Q9H2W2 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MIXL1Q9H2W2 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
MIXL1Q9H2W2 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MIXL1Q9H2W2 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MIXL1Q9H2W2 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
MIXL1Q9H2W2 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MIXL1Q9H2W2 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MIXL1Q9H2W2 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MIXL1Q9H2W2 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MIXL1Q9H2W2 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
MIXL1Q9H2W2 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MIXL1Q9H2W2 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
MIXL1Q9H2W2 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MIXL1Q9H2W2 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MIXL1Q9H2W2 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MIXL1Q9H2W2 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MIXL1Q9H2W2 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
MIXL1Q9H2W2 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MIXL1Q9H2W2 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MIXL1Q9H2W2 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MIXL1Q9H2W2 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MIXL1Q9H2W2 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MIXL1Q9H2W2 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MIXL1Q9H2W2 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MIXL1Q9H2W2 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MIXL1Q9H2W2 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MIXL1Q9H2W2 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MIXL1Q9H2W2 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MIXL1Q9H2W2 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MIXL1Q9H2W2 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MIXL1Q9H2W2 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MIXL1Q9H2W2 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
MIXL1Q9H2W2 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MIXL1Q9H2W2 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MIXL1Q9H2W2 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MIXL1Q9H2W2 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MIXL1Q9H2W2 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
MIXL1Q9H2W2 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MIXL1Q9H2W2 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MIXL1Q9H2W2 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MIXL1Q9H2W2 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MIXL1Q9H2W2 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
MIXL1Q9H2W2 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
MIXL1Q9H2W2 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
MIXL1Q9H2W2 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
MIXL1Q9H2W2 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
MIXL1Q9H2W2 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
MIXL1Q9H2W2 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
MIXL1Q9H2W2 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
MIXL1Q9H2W2 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
MIXL1Q9H2W2 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MIXL1Q9H2W2 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
MIXL1Q9H2W2 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
MIXL1Q9H2W2 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
MIXL1Q9H2W2 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
MIXL1Q9H2W2 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
MIXL1Q9H2W2 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
MIXL1Q9H2W2 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
MIXL1Q9H2W2 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
MIXL1Q9H2W2 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
MIXL1Q9H2W2 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
MIXL1Q9H2W2 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
MIXL1Q9H2W2 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
MIXL1Q9H2W2 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
MIXL1Q9H2W2 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
MIXL1Q9H2W2 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
MIXL1Q9H2W2 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
MIXL1Q9H2W2 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
MIXL1Q9H2W2 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
MIXL1Q9H2W2 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
MIXL1Q9H2W2 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
MIXL1Q9H2W2 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
MIXL1Q9H2W2 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MIXL1Q9H2W2 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MIXL1Q9H2W2 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MIXL1Q9H2W2 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MIXL1Q9H2W2 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MIXL1Q9H2W2 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MIXL1Q9H2W2 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MIXL1Q9H2W2 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MIXL1Q9H2W2 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
MIXL1Q9H2W2 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MIXL1Q9H2W2 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms