Protein–RNA interactions for Protein: Q9H254

SPTBN4, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 4, humanhuman

Predictions only

Length 2,564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN4Q9H254 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SPTBN4Q9H254 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SPTBN4Q9H254 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SPTBN4Q9H254 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SPTBN4Q9H254 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SPTBN4Q9H254 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SPTBN4Q9H254 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SPTBN4Q9H254 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SPTBN4Q9H254 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SPTBN4Q9H254 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SPTBN4Q9H254 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPTBN4Q9H254 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPTBN4Q9H254 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPTBN4Q9H254 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPTBN4Q9H254 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPTBN4Q9H254 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPTBN4Q9H254 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SPTBN4Q9H254 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPTBN4Q9H254 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SPTBN4Q9H254 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SPTBN4Q9H254 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SPTBN4Q9H254 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SPTBN4Q9H254 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPTBN4Q9H254 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPTBN4Q9H254 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPTBN4Q9H254 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPTBN4Q9H254 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SPTBN4Q9H254 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SPTBN4Q9H254 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SPTBN4Q9H254 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SPTBN4Q9H254 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SPTBN4Q9H254 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SPTBN4Q9H254 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
SPTBN4Q9H254 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SPTBN4Q9H254 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SPTBN4Q9H254 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SPTBN4Q9H254 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SPTBN4Q9H254 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SPTBN4Q9H254 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SPTBN4Q9H254 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SPTBN4Q9H254 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SPTBN4Q9H254 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SPTBN4Q9H254 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SPTBN4Q9H254 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SPTBN4Q9H254 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SPTBN4Q9H254 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SPTBN4Q9H254 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SPTBN4Q9H254 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SPTBN4Q9H254 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SPTBN4Q9H254 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SPTBN4Q9H254 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SPTBN4Q9H254 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SPTBN4Q9H254 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SPTBN4Q9H254 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SPTBN4Q9H254 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SPTBN4Q9H254 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SPTBN4Q9H254 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SPTBN4Q9H254 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SPTBN4Q9H254 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SPTBN4Q9H254 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SPTBN4Q9H254 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SPTBN4Q9H254 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SPTBN4Q9H254 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SPTBN4Q9H254 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SPTBN4Q9H254 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SPTBN4Q9H254 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SPTBN4Q9H254 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SPTBN4Q9H254 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SPTBN4Q9H254 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SPTBN4Q9H254 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SPTBN4Q9H254 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPTBN4Q9H254 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPTBN4Q9H254 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPTBN4Q9H254 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPTBN4Q9H254 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPTBN4Q9H254 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPTBN4Q9H254 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPTBN4Q9H254 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPTBN4Q9H254 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPTBN4Q9H254 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SPTBN4Q9H254 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPTBN4Q9H254 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SPTBN4Q9H254 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPTBN4Q9H254 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPTBN4Q9H254 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPTBN4Q9H254 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPTBN4Q9H254 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SPTBN4Q9H254 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SPTBN4Q9H254 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SPTBN4Q9H254 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPTBN4Q9H254 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPTBN4Q9H254 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPTBN4Q9H254 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPTBN4Q9H254 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPTBN4Q9H254 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPTBN4Q9H254 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPTBN4Q9H254 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPTBN4Q9H254 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPTBN4Q9H254 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPTBN4Q9H254 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms