Protein–RNA interactions for Protein: Q9H195

MUC3B, Mucin-3B (Fragments), humanhuman

Predictions only

Length 1,237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MUC3BQ9H195 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MUC3BQ9H195 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MUC3BQ9H195 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MUC3BQ9H195 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MUC3BQ9H195 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MUC3BQ9H195 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
MUC3BQ9H195 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MUC3BQ9H195 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MUC3BQ9H195 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MUC3BQ9H195 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MUC3BQ9H195 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MUC3BQ9H195 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MUC3BQ9H195 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MUC3BQ9H195 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
MUC3BQ9H195 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MUC3BQ9H195 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MUC3BQ9H195 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MUC3BQ9H195 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MUC3BQ9H195 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MUC3BQ9H195 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MUC3BQ9H195 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MUC3BQ9H195 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MUC3BQ9H195 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
MUC3BQ9H195 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MUC3BQ9H195 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
MUC3BQ9H195 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MUC3BQ9H195 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MUC3BQ9H195 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MUC3BQ9H195 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MUC3BQ9H195 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MUC3BQ9H195 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MUC3BQ9H195 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
MUC3BQ9H195 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MUC3BQ9H195 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MUC3BQ9H195 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MUC3BQ9H195 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MUC3BQ9H195 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MUC3BQ9H195 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MUC3BQ9H195 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MUC3BQ9H195 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MUC3BQ9H195 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MUC3BQ9H195 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MUC3BQ9H195 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MUC3BQ9H195 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MUC3BQ9H195 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
MUC3BQ9H195 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MUC3BQ9H195 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MUC3BQ9H195 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MUC3BQ9H195 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MUC3BQ9H195 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MUC3BQ9H195 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MUC3BQ9H195 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MUC3BQ9H195 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MUC3BQ9H195 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MUC3BQ9H195 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MUC3BQ9H195 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MUC3BQ9H195 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MUC3BQ9H195 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MUC3BQ9H195 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MUC3BQ9H195 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MUC3BQ9H195 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MUC3BQ9H195 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MUC3BQ9H195 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MUC3BQ9H195 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MUC3BQ9H195 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MUC3BQ9H195 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MUC3BQ9H195 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MUC3BQ9H195 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MUC3BQ9H195 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MUC3BQ9H195 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MUC3BQ9H195 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MUC3BQ9H195 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MUC3BQ9H195 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MUC3BQ9H195 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MUC3BQ9H195 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MUC3BQ9H195 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MUC3BQ9H195 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MUC3BQ9H195 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MUC3BQ9H195 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MUC3BQ9H195 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MUC3BQ9H195 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MUC3BQ9H195 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MUC3BQ9H195 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MUC3BQ9H195 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MUC3BQ9H195 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MUC3BQ9H195 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MUC3BQ9H195 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MUC3BQ9H195 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MUC3BQ9H195 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MUC3BQ9H195 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MUC3BQ9H195 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MUC3BQ9H195 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MUC3BQ9H195 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MUC3BQ9H195 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MUC3BQ9H195 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
MUC3BQ9H195 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
MUC3BQ9H195 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MUC3BQ9H195 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MUC3BQ9H195 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MUC3BQ9H195 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.5 ms