Protein–RNA interactions for Protein: Q9H082

RAB33B, Ras-related protein Rab-33B, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB33BQ9H082 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAB33BQ9H082 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB33BQ9H082 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB33BQ9H082 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB33BQ9H082 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB33BQ9H082 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB33BQ9H082 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAB33BQ9H082 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAB33BQ9H082 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAB33BQ9H082 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAB33BQ9H082 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAB33BQ9H082 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAB33BQ9H082 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAB33BQ9H082 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAB33BQ9H082 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
RAB33BQ9H082 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAB33BQ9H082 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAB33BQ9H082 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAB33BQ9H082 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAB33BQ9H082 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAB33BQ9H082 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAB33BQ9H082 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAB33BQ9H082 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB33BQ9H082 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB33BQ9H082 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB33BQ9H082 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB33BQ9H082 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB33BQ9H082 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB33BQ9H082 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB33BQ9H082 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB33BQ9H082 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB33BQ9H082 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB33BQ9H082 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAB33BQ9H082 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAB33BQ9H082 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAB33BQ9H082 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAB33BQ9H082 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB33BQ9H082 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB33BQ9H082 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB33BQ9H082 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB33BQ9H082 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB33BQ9H082 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB33BQ9H082 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB33BQ9H082 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB33BQ9H082 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB33BQ9H082 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB33BQ9H082 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB33BQ9H082 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB33BQ9H082 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB33BQ9H082 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB33BQ9H082 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB33BQ9H082 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
RAB33BQ9H082 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
RAB33BQ9H082 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAB33BQ9H082 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAB33BQ9H082 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAB33BQ9H082 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAB33BQ9H082 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAB33BQ9H082 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAB33BQ9H082 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAB33BQ9H082 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAB33BQ9H082 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAB33BQ9H082 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAB33BQ9H082 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAB33BQ9H082 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAB33BQ9H082 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAB33BQ9H082 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAB33BQ9H082 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAB33BQ9H082 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAB33BQ9H082 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAB33BQ9H082 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAB33BQ9H082 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAB33BQ9H082 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAB33BQ9H082 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAB33BQ9H082 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAB33BQ9H082 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAB33BQ9H082 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
RAB33BQ9H082 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAB33BQ9H082 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAB33BQ9H082 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAB33BQ9H082 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAB33BQ9H082 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAB33BQ9H082 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAB33BQ9H082 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAB33BQ9H082 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAB33BQ9H082 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAB33BQ9H082 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAB33BQ9H082 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAB33BQ9H082 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAB33BQ9H082 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RAB33BQ9H082 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
RAB33BQ9H082 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RAB33BQ9H082 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RAB33BQ9H082 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RAB33BQ9H082 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
RAB33BQ9H082 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RAB33BQ9H082 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RAB33BQ9H082 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RAB33BQ9H082 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB33BQ9H082 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms