Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZP7

VN1R1, Vomeronasal type-1 receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R1Q9GZP7 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VN1R1Q9GZP7 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VN1R1Q9GZP7 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VN1R1Q9GZP7 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VN1R1Q9GZP7 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VN1R1Q9GZP7 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VN1R1Q9GZP7 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VN1R1Q9GZP7 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VN1R1Q9GZP7 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VN1R1Q9GZP7 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VN1R1Q9GZP7 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VN1R1Q9GZP7 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VN1R1Q9GZP7 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VN1R1Q9GZP7 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VN1R1Q9GZP7 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VN1R1Q9GZP7 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VN1R1Q9GZP7 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VN1R1Q9GZP7 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VN1R1Q9GZP7 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VN1R1Q9GZP7 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VN1R1Q9GZP7 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VN1R1Q9GZP7 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VN1R1Q9GZP7 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VN1R1Q9GZP7 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VN1R1Q9GZP7 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VN1R1Q9GZP7 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VN1R1Q9GZP7 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VN1R1Q9GZP7 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VN1R1Q9GZP7 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VN1R1Q9GZP7 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VN1R1Q9GZP7 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VN1R1Q9GZP7 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VN1R1Q9GZP7 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VN1R1Q9GZP7 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VN1R1Q9GZP7 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VN1R1Q9GZP7 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VN1R1Q9GZP7 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VN1R1Q9GZP7 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VN1R1Q9GZP7 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
VN1R1Q9GZP7 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VN1R1Q9GZP7 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VN1R1Q9GZP7 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VN1R1Q9GZP7 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VN1R1Q9GZP7 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VN1R1Q9GZP7 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VN1R1Q9GZP7 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VN1R1Q9GZP7 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VN1R1Q9GZP7 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VN1R1Q9GZP7 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VN1R1Q9GZP7 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VN1R1Q9GZP7 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
VN1R1Q9GZP7 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VN1R1Q9GZP7 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VN1R1Q9GZP7 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VN1R1Q9GZP7 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VN1R1Q9GZP7 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VN1R1Q9GZP7 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
VN1R1Q9GZP7 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VN1R1Q9GZP7 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VN1R1Q9GZP7 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
VN1R1Q9GZP7 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
VN1R1Q9GZP7 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
VN1R1Q9GZP7 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
VN1R1Q9GZP7 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
VN1R1Q9GZP7 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
VN1R1Q9GZP7 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
VN1R1Q9GZP7 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
VN1R1Q9GZP7 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VN1R1Q9GZP7 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VN1R1Q9GZP7 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
VN1R1Q9GZP7 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VN1R1Q9GZP7 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
VN1R1Q9GZP7 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VN1R1Q9GZP7 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
VN1R1Q9GZP7 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VN1R1Q9GZP7 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
VN1R1Q9GZP7 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VN1R1Q9GZP7 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VN1R1Q9GZP7 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
VN1R1Q9GZP7 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VN1R1Q9GZP7 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VN1R1Q9GZP7 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VN1R1Q9GZP7 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VN1R1Q9GZP7 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
VN1R1Q9GZP7 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VN1R1Q9GZP7 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VN1R1Q9GZP7 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VN1R1Q9GZP7 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
VN1R1Q9GZP7 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VN1R1Q9GZP7 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VN1R1Q9GZP7 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VN1R1Q9GZP7 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VN1R1Q9GZP7 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VN1R1Q9GZP7 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VN1R1Q9GZP7 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VN1R1Q9GZP7 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VN1R1Q9GZP7 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VN1R1Q9GZP7 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VN1R1Q9GZP7 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
VN1R1Q9GZP7 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms