Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYS1

KRTAP1-5, Keratin-associated protein 1-5, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP1-5Q9BYS1 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRTAP1-5Q9BYS1 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRTAP1-5Q9BYS1 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRTAP1-5Q9BYS1 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRTAP1-5Q9BYS1 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRTAP1-5Q9BYS1 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRTAP1-5Q9BYS1 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRTAP1-5Q9BYS1 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
KRTAP1-5Q9BYS1 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRTAP1-5Q9BYS1 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRTAP1-5Q9BYS1 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRTAP1-5Q9BYS1 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRTAP1-5Q9BYS1 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRTAP1-5Q9BYS1 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRTAP1-5Q9BYS1 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRTAP1-5Q9BYS1 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KRTAP1-5Q9BYS1 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KRTAP1-5Q9BYS1 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KRTAP1-5Q9BYS1 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KRTAP1-5Q9BYS1 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KRTAP1-5Q9BYS1 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KRTAP1-5Q9BYS1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KRTAP1-5Q9BYS1 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KRTAP1-5Q9BYS1 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KRTAP1-5Q9BYS1 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KRTAP1-5Q9BYS1 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KRTAP1-5Q9BYS1 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KRTAP1-5Q9BYS1 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KRTAP1-5Q9BYS1 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KRTAP1-5Q9BYS1 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KRTAP1-5Q9BYS1 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KRTAP1-5Q9BYS1 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
KRTAP1-5Q9BYS1 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
KRTAP1-5Q9BYS1 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
KRTAP1-5Q9BYS1 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KRTAP1-5Q9BYS1 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KRTAP1-5Q9BYS1 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KRTAP1-5Q9BYS1 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KRTAP1-5Q9BYS1 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KRTAP1-5Q9BYS1 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KRTAP1-5Q9BYS1 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KRTAP1-5Q9BYS1 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KRTAP1-5Q9BYS1 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KRTAP1-5Q9BYS1 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KRTAP1-5Q9BYS1 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KRTAP1-5Q9BYS1 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KRTAP1-5Q9BYS1 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KRTAP1-5Q9BYS1 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KRTAP1-5Q9BYS1 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KRTAP1-5Q9BYS1 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KRTAP1-5Q9BYS1 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
KRTAP1-5Q9BYS1 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KRTAP1-5Q9BYS1 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KRTAP1-5Q9BYS1 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
KRTAP1-5Q9BYS1 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KRTAP1-5Q9BYS1 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KRTAP1-5Q9BYS1 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KRTAP1-5Q9BYS1 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
KRTAP1-5Q9BYS1 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KRTAP1-5Q9BYS1 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KRTAP1-5Q9BYS1 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KRTAP1-5Q9BYS1 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KRTAP1-5Q9BYS1 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KRTAP1-5Q9BYS1 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KRTAP1-5Q9BYS1 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KRTAP1-5Q9BYS1 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KRTAP1-5Q9BYS1 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
KRTAP1-5Q9BYS1 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KRTAP1-5Q9BYS1 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KRTAP1-5Q9BYS1 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KRTAP1-5Q9BYS1 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KRTAP1-5Q9BYS1 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KRTAP1-5Q9BYS1 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KRTAP1-5Q9BYS1 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KRTAP1-5Q9BYS1 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
KRTAP1-5Q9BYS1 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KRTAP1-5Q9BYS1 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KRTAP1-5Q9BYS1 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KRTAP1-5Q9BYS1 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KRTAP1-5Q9BYS1 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KRTAP1-5Q9BYS1 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KRTAP1-5Q9BYS1 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KRTAP1-5Q9BYS1 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KRTAP1-5Q9BYS1 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KRTAP1-5Q9BYS1 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KRTAP1-5Q9BYS1 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KRTAP1-5Q9BYS1 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
KRTAP1-5Q9BYS1 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
KRTAP1-5Q9BYS1 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KRTAP1-5Q9BYS1 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
KRTAP1-5Q9BYS1 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
KRTAP1-5Q9BYS1 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KRTAP1-5Q9BYS1 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KRTAP1-5Q9BYS1 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KRTAP1-5Q9BYS1 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KRTAP1-5Q9BYS1 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KRTAP1-5Q9BYS1 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KRTAP1-5Q9BYS1 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KRTAP1-5Q9BYS1 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KRTAP1-5Q9BYS1 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82 ms