Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXP5

SRRT, Serrate RNA effector molecule homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 876 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRTQ9BXP5 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SRRTQ9BXP5 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SRRTQ9BXP5 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SRRTQ9BXP5 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SRRTQ9BXP5 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SRRTQ9BXP5 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SRRTQ9BXP5 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SRRTQ9BXP5 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SRRTQ9BXP5 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SRRTQ9BXP5 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SRRTQ9BXP5 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.88
SRRTQ9BXP5 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
SRRTQ9BXP5 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SRRTQ9BXP5 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SRRTQ9BXP5 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SRRTQ9BXP5 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SRRTQ9BXP5 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SRRTQ9BXP5 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SRRTQ9BXP5 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SRRTQ9BXP5 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SRRTQ9BXP5 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SRRTQ9BXP5 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SRRTQ9BXP5 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SRRTQ9BXP5 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SRRTQ9BXP5 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SRRTQ9BXP5 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SRRTQ9BXP5 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SRRTQ9BXP5 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SRRTQ9BXP5 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SRRTQ9BXP5 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SRRTQ9BXP5 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SRRTQ9BXP5 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SRRTQ9BXP5 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SRRTQ9BXP5 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SRRTQ9BXP5 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SRRTQ9BXP5 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
SRRTQ9BXP5 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SRRTQ9BXP5 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SRRTQ9BXP5 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SRRTQ9BXP5 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SRRTQ9BXP5 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SRRTQ9BXP5 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SRRTQ9BXP5 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
SRRTQ9BXP5 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SRRTQ9BXP5 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SRRTQ9BXP5 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SRRTQ9BXP5 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SRRTQ9BXP5 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SRRTQ9BXP5 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SRRTQ9BXP5 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SRRTQ9BXP5 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SRRTQ9BXP5 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SRRTQ9BXP5 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SRRTQ9BXP5 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SRRTQ9BXP5 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SRRTQ9BXP5 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SRRTQ9BXP5 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SRRTQ9BXP5 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SRRTQ9BXP5 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SRRTQ9BXP5 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SRRTQ9BXP5 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SRRTQ9BXP5 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SRRTQ9BXP5 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SRRTQ9BXP5 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SRRTQ9BXP5 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SRRTQ9BXP5 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
SRRTQ9BXP5 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SRRTQ9BXP5 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SRRTQ9BXP5 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SRRTQ9BXP5 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SRRTQ9BXP5 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
SRRTQ9BXP5 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SRRTQ9BXP5 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SRRTQ9BXP5 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SRRTQ9BXP5 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SRRTQ9BXP5 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SRRTQ9BXP5 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SRRTQ9BXP5 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SRRTQ9BXP5 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SRRTQ9BXP5 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SRRTQ9BXP5 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
SRRTQ9BXP5 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SRRTQ9BXP5 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SRRTQ9BXP5 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SRRTQ9BXP5 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SRRTQ9BXP5 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SRRTQ9BXP5 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SRRTQ9BXP5 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SRRTQ9BXP5 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SRRTQ9BXP5 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SRRTQ9BXP5 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SRRTQ9BXP5 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SRRTQ9BXP5 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SRRTQ9BXP5 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SRRTQ9BXP5 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SRRTQ9BXP5 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SRRTQ9BXP5 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SRRTQ9BXP5 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SRRTQ9BXP5 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SRRTQ9BXP5 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.3 ms