Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUF7

CRB3, Protein crumbs homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRB3Q9BUF7 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CRB3Q9BUF7 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CRB3Q9BUF7 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRB3Q9BUF7 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRB3Q9BUF7 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRB3Q9BUF7 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRB3Q9BUF7 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRB3Q9BUF7 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CRB3Q9BUF7 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CRB3Q9BUF7 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CRB3Q9BUF7 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CRB3Q9BUF7 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CRB3Q9BUF7 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CRB3Q9BUF7 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CRB3Q9BUF7 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CRB3Q9BUF7 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CRB3Q9BUF7 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CRB3Q9BUF7 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CRB3Q9BUF7 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CRB3Q9BUF7 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CRB3Q9BUF7 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CRB3Q9BUF7 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CRB3Q9BUF7 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CRB3Q9BUF7 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CRB3Q9BUF7 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CRB3Q9BUF7 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CRB3Q9BUF7 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CRB3Q9BUF7 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CRB3Q9BUF7 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CRB3Q9BUF7 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CRB3Q9BUF7 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CRB3Q9BUF7 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CRB3Q9BUF7 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CRB3Q9BUF7 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CRB3Q9BUF7 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CRB3Q9BUF7 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CRB3Q9BUF7 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CRB3Q9BUF7 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CRB3Q9BUF7 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CRB3Q9BUF7 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CRB3Q9BUF7 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CRB3Q9BUF7 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CRB3Q9BUF7 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CRB3Q9BUF7 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CRB3Q9BUF7 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CRB3Q9BUF7 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CRB3Q9BUF7 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CRB3Q9BUF7 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CRB3Q9BUF7 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CRB3Q9BUF7 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CRB3Q9BUF7 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CRB3Q9BUF7 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CRB3Q9BUF7 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CRB3Q9BUF7 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CRB3Q9BUF7 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CRB3Q9BUF7 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CRB3Q9BUF7 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CRB3Q9BUF7 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CRB3Q9BUF7 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CRB3Q9BUF7 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CRB3Q9BUF7 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CRB3Q9BUF7 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CRB3Q9BUF7 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CRB3Q9BUF7 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CRB3Q9BUF7 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CRB3Q9BUF7 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CRB3Q9BUF7 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CRB3Q9BUF7 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CRB3Q9BUF7 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CRB3Q9BUF7 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CRB3Q9BUF7 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CRB3Q9BUF7 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CRB3Q9BUF7 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CRB3Q9BUF7 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CRB3Q9BUF7 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CRB3Q9BUF7 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CRB3Q9BUF7 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CRB3Q9BUF7 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CRB3Q9BUF7 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CRB3Q9BUF7 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CRB3Q9BUF7 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CRB3Q9BUF7 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CRB3Q9BUF7 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CRB3Q9BUF7 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CRB3Q9BUF7 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CRB3Q9BUF7 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CRB3Q9BUF7 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CRB3Q9BUF7 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CRB3Q9BUF7 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CRB3Q9BUF7 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CRB3Q9BUF7 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CRB3Q9BUF7 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CRB3Q9BUF7 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CRB3Q9BUF7 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CRB3Q9BUF7 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CRB3Q9BUF7 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CRB3Q9BUF7 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CRB3Q9BUF7 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CRB3Q9BUF7 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CRB3Q9BUF7 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms