Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRP1

PDCD2L, Programmed cell death protein 2-like, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD2LQ9BRP1 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
PDCD2LQ9BRP1 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PDCD2LQ9BRP1 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PDCD2LQ9BRP1 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
PDCD2LQ9BRP1 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PDCD2LQ9BRP1 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PDCD2LQ9BRP1 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
PDCD2LQ9BRP1 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PDCD2LQ9BRP1 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
PDCD2LQ9BRP1 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PDCD2LQ9BRP1 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PDCD2LQ9BRP1 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PDCD2LQ9BRP1 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PDCD2LQ9BRP1 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PDCD2LQ9BRP1 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PDCD2LQ9BRP1 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PDCD2LQ9BRP1 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
PDCD2LQ9BRP1 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.53■■■□□ 2
PDCD2LQ9BRP1 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.53■■■□□ 2
PDCD2LQ9BRP1 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PDCD2LQ9BRP1 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PDCD2LQ9BRP1 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC27.52■■■□□ 2
PDCD2LQ9BRP1 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PDCD2LQ9BRP1 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PDCD2LQ9BRP1 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PDCD2LQ9BRP1 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PDCD2LQ9BRP1 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PDCD2LQ9BRP1 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PDCD2LQ9BRP1 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PDCD2LQ9BRP1 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
PDCD2LQ9BRP1 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PDCD2LQ9BRP1 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PDCD2LQ9BRP1 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PDCD2LQ9BRP1 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PDCD2LQ9BRP1 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PDCD2LQ9BRP1 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PDCD2LQ9BRP1 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PDCD2LQ9BRP1 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PDCD2LQ9BRP1 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PDCD2LQ9BRP1 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PDCD2LQ9BRP1 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PDCD2LQ9BRP1 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PDCD2LQ9BRP1 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PDCD2LQ9BRP1 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PDCD2LQ9BRP1 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PDCD2LQ9BRP1 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PDCD2LQ9BRP1 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PDCD2LQ9BRP1 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PDCD2LQ9BRP1 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PDCD2LQ9BRP1 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PDCD2LQ9BRP1 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PDCD2LQ9BRP1 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PDCD2LQ9BRP1 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PDCD2LQ9BRP1 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PDCD2LQ9BRP1 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PDCD2LQ9BRP1 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
PDCD2LQ9BRP1 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
PDCD2LQ9BRP1 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PDCD2LQ9BRP1 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PDCD2LQ9BRP1 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PDCD2LQ9BRP1 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PDCD2LQ9BRP1 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PDCD2LQ9BRP1 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PDCD2LQ9BRP1 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PDCD2LQ9BRP1 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PDCD2LQ9BRP1 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
PDCD2LQ9BRP1 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PDCD2LQ9BRP1 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PDCD2LQ9BRP1 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PDCD2LQ9BRP1 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PDCD2LQ9BRP1 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PDCD2LQ9BRP1 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PDCD2LQ9BRP1 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PDCD2LQ9BRP1 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PDCD2LQ9BRP1 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
PDCD2LQ9BRP1 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PDCD2LQ9BRP1 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PDCD2LQ9BRP1 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PDCD2LQ9BRP1 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
PDCD2LQ9BRP1 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PDCD2LQ9BRP1 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PDCD2LQ9BRP1 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PDCD2LQ9BRP1 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PDCD2LQ9BRP1 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PDCD2LQ9BRP1 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PDCD2LQ9BRP1 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PDCD2LQ9BRP1 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PDCD2LQ9BRP1 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PDCD2LQ9BRP1 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
PDCD2LQ9BRP1 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PDCD2LQ9BRP1 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PDCD2LQ9BRP1 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PDCD2LQ9BRP1 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PDCD2LQ9BRP1 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PDCD2LQ9BRP1 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PDCD2LQ9BRP1 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PDCD2LQ9BRP1 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PDCD2LQ9BRP1 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PDCD2LQ9BRP1 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PDCD2LQ9BRP1 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms