Protein–RNA interactions for Protein: Q99966

CITED1, Cbp/p300-interacting transactivator 1, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED1Q99966 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CITED1Q99966 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CITED1Q99966 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CITED1Q99966 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CITED1Q99966 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CITED1Q99966 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CITED1Q99966 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CITED1Q99966 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CITED1Q99966 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CITED1Q99966 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CITED1Q99966 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CITED1Q99966 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CITED1Q99966 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CITED1Q99966 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CITED1Q99966 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CITED1Q99966 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CITED1Q99966 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CITED1Q99966 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CITED1Q99966 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CITED1Q99966 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CITED1Q99966 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CITED1Q99966 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CITED1Q99966 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CITED1Q99966 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CITED1Q99966 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CITED1Q99966 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CITED1Q99966 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CITED1Q99966 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CITED1Q99966 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CITED1Q99966 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CITED1Q99966 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CITED1Q99966 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CITED1Q99966 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CITED1Q99966 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CITED1Q99966 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CITED1Q99966 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CITED1Q99966 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CITED1Q99966 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CITED1Q99966 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CITED1Q99966 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CITED1Q99966 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CITED1Q99966 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CITED1Q99966 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CITED1Q99966 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CITED1Q99966 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CITED1Q99966 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CITED1Q99966 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CITED1Q99966 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CITED1Q99966 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CITED1Q99966 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CITED1Q99966 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CITED1Q99966 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CITED1Q99966 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CITED1Q99966 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CITED1Q99966 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CITED1Q99966 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CITED1Q99966 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CITED1Q99966 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CITED1Q99966 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CITED1Q99966 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CITED1Q99966 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CITED1Q99966 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CITED1Q99966 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CITED1Q99966 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CITED1Q99966 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CITED1Q99966 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CITED1Q99966 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CITED1Q99966 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CITED1Q99966 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CITED1Q99966 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CITED1Q99966 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CITED1Q99966 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CITED1Q99966 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
CITED1Q99966 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CITED1Q99966 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CITED1Q99966 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CITED1Q99966 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
CITED1Q99966 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
CITED1Q99966 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CITED1Q99966 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CITED1Q99966 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CITED1Q99966 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CITED1Q99966 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CITED1Q99966 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CITED1Q99966 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CITED1Q99966 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CITED1Q99966 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CITED1Q99966 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CITED1Q99966 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CITED1Q99966 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CITED1Q99966 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CITED1Q99966 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CITED1Q99966 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CITED1Q99966 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CITED1Q99966 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CITED1Q99966 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CITED1Q99966 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CITED1Q99966 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CITED1Q99966 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CITED1Q99966 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms