Protein–RNA interactions for Protein: Q96SN8

CDK5RAP2, CDK5 regulatory subunit-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,893 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP2Q96SN8 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CDK5RAP2Q96SN8 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CDK5RAP2Q96SN8 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CDK5RAP2Q96SN8 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CDK5RAP2Q96SN8 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CDK5RAP2Q96SN8 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CDK5RAP2Q96SN8 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CDK5RAP2Q96SN8 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CDK5RAP2Q96SN8 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CDK5RAP2Q96SN8 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CDK5RAP2Q96SN8 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CDK5RAP2Q96SN8 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CDK5RAP2Q96SN8 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CDK5RAP2Q96SN8 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CDK5RAP2Q96SN8 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CDK5RAP2Q96SN8 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
CDK5RAP2Q96SN8 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CDK5RAP2Q96SN8 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CDK5RAP2Q96SN8 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
CDK5RAP2Q96SN8 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
CDK5RAP2Q96SN8 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CDK5RAP2Q96SN8 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CDK5RAP2Q96SN8 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CDK5RAP2Q96SN8 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CDK5RAP2Q96SN8 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CDK5RAP2Q96SN8 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CDK5RAP2Q96SN8 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CDK5RAP2Q96SN8 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CDK5RAP2Q96SN8 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC28.89■■■□□ 2.21
CDK5RAP2Q96SN8 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
CDK5RAP2Q96SN8 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
CDK5RAP2Q96SN8 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CDK5RAP2Q96SN8 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CDK5RAP2Q96SN8 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CDK5RAP2Q96SN8 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CDK5RAP2Q96SN8 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CDK5RAP2Q96SN8 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CDK5RAP2Q96SN8 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CDK5RAP2Q96SN8 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CDK5RAP2Q96SN8 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CDK5RAP2Q96SN8 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CDK5RAP2Q96SN8 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CDK5RAP2Q96SN8 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CDK5RAP2Q96SN8 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CDK5RAP2Q96SN8 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CDK5RAP2Q96SN8 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CDK5RAP2Q96SN8 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CDK5RAP2Q96SN8 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CDK5RAP2Q96SN8 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CDK5RAP2Q96SN8 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CDK5RAP2Q96SN8 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CDK5RAP2Q96SN8 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CDK5RAP2Q96SN8 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CDK5RAP2Q96SN8 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CDK5RAP2Q96SN8 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CDK5RAP2Q96SN8 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CDK5RAP2Q96SN8 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CDK5RAP2Q96SN8 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CDK5RAP2Q96SN8 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CDK5RAP2Q96SN8 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CDK5RAP2Q96SN8 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
CDK5RAP2Q96SN8 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
CDK5RAP2Q96SN8 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CDK5RAP2Q96SN8 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CDK5RAP2Q96SN8 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CDK5RAP2Q96SN8 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CDK5RAP2Q96SN8 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
CDK5RAP2Q96SN8 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CDK5RAP2Q96SN8 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.2
CDK5RAP2Q96SN8 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CDK5RAP2Q96SN8 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CDK5RAP2Q96SN8 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CDK5RAP2Q96SN8 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CDK5RAP2Q96SN8 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CDK5RAP2Q96SN8 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CDK5RAP2Q96SN8 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CDK5RAP2Q96SN8 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CDK5RAP2Q96SN8 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CDK5RAP2Q96SN8 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CDK5RAP2Q96SN8 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
CDK5RAP2Q96SN8 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CDK5RAP2Q96SN8 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CDK5RAP2Q96SN8 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CDK5RAP2Q96SN8 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CDK5RAP2Q96SN8 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CDK5RAP2Q96SN8 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CDK5RAP2Q96SN8 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
CDK5RAP2Q96SN8 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CDK5RAP2Q96SN8 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CDK5RAP2Q96SN8 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CDK5RAP2Q96SN8 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CDK5RAP2Q96SN8 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CDK5RAP2Q96SN8 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CDK5RAP2Q96SN8 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CDK5RAP2Q96SN8 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CDK5RAP2Q96SN8 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CDK5RAP2Q96SN8 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CDK5RAP2Q96SN8 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CDK5RAP2Q96SN8 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CDK5RAP2Q96SN8 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms