Protein–RNA interactions for Protein: Q96PX6

CCDC85A, Coiled-coil domain-containing protein 85A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85AQ96PX6 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
CCDC85AQ96PX6 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
CCDC85AQ96PX6 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
CCDC85AQ96PX6 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
CCDC85AQ96PX6 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
CCDC85AQ96PX6 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
CCDC85AQ96PX6 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
CCDC85AQ96PX6 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
CCDC85AQ96PX6 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
CCDC85AQ96PX6 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
CCDC85AQ96PX6 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
CCDC85AQ96PX6 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
CCDC85AQ96PX6 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
CCDC85AQ96PX6 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
CCDC85AQ96PX6 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC30.27■■■□□ 2.44
CCDC85AQ96PX6 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
CCDC85AQ96PX6 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
CCDC85AQ96PX6 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
CCDC85AQ96PX6 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
CCDC85AQ96PX6 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
CCDC85AQ96PX6 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
CCDC85AQ96PX6 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
CCDC85AQ96PX6 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
CCDC85AQ96PX6 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
CCDC85AQ96PX6 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
CCDC85AQ96PX6 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
CCDC85AQ96PX6 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
CCDC85AQ96PX6 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
CCDC85AQ96PX6 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
CCDC85AQ96PX6 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
CCDC85AQ96PX6 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
CCDC85AQ96PX6 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
CCDC85AQ96PX6 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
CCDC85AQ96PX6 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
CCDC85AQ96PX6 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
CCDC85AQ96PX6 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
CCDC85AQ96PX6 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
CCDC85AQ96PX6 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
CCDC85AQ96PX6 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
CCDC85AQ96PX6 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
CCDC85AQ96PX6 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
CCDC85AQ96PX6 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CCDC85AQ96PX6 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CCDC85AQ96PX6 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
CCDC85AQ96PX6 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CCDC85AQ96PX6 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
CCDC85AQ96PX6 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
CCDC85AQ96PX6 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
CCDC85AQ96PX6 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
CCDC85AQ96PX6 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
CCDC85AQ96PX6 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
CCDC85AQ96PX6 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.43
CCDC85AQ96PX6 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
CCDC85AQ96PX6 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.43
CCDC85AQ96PX6 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.43
CCDC85AQ96PX6 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
CCDC85AQ96PX6 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CCDC85AQ96PX6 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
CCDC85AQ96PX6 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CCDC85AQ96PX6 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CCDC85AQ96PX6 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CCDC85AQ96PX6 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CCDC85AQ96PX6 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CCDC85AQ96PX6 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
CCDC85AQ96PX6 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CCDC85AQ96PX6 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CCDC85AQ96PX6 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
CCDC85AQ96PX6 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
CCDC85AQ96PX6 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
CCDC85AQ96PX6 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
CCDC85AQ96PX6 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
CCDC85AQ96PX6 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CCDC85AQ96PX6 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CCDC85AQ96PX6 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CCDC85AQ96PX6 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CCDC85AQ96PX6 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CCDC85AQ96PX6 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
CCDC85AQ96PX6 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
CCDC85AQ96PX6 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
CCDC85AQ96PX6 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
CCDC85AQ96PX6 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CCDC85AQ96PX6 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CCDC85AQ96PX6 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CCDC85AQ96PX6 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CCDC85AQ96PX6 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC30.12■■■□□ 2.41
CCDC85AQ96PX6 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
CCDC85AQ96PX6 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
CCDC85AQ96PX6 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
CCDC85AQ96PX6 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
CCDC85AQ96PX6 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CCDC85AQ96PX6 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
CCDC85AQ96PX6 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
CCDC85AQ96PX6 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CCDC85AQ96PX6 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
CCDC85AQ96PX6 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
CCDC85AQ96PX6 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CCDC85AQ96PX6 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CCDC85AQ96PX6 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC30.1■■■□□ 2.41
CCDC85AQ96PX6 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
CCDC85AQ96PX6 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms