Protein–RNA interactions for Protein: Q96GM5

SMARCD1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD1Q96GM5 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SMARCD1Q96GM5 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SMARCD1Q96GM5 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SMARCD1Q96GM5 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SMARCD1Q96GM5 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
SMARCD1Q96GM5 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
SMARCD1Q96GM5 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SMARCD1Q96GM5 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SMARCD1Q96GM5 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SMARCD1Q96GM5 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SMARCD1Q96GM5 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
SMARCD1Q96GM5 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SMARCD1Q96GM5 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SMARCD1Q96GM5 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SMARCD1Q96GM5 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SMARCD1Q96GM5 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SMARCD1Q96GM5 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SMARCD1Q96GM5 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SMARCD1Q96GM5 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SMARCD1Q96GM5 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SMARCD1Q96GM5 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SMARCD1Q96GM5 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SMARCD1Q96GM5 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SMARCD1Q96GM5 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SMARCD1Q96GM5 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SMARCD1Q96GM5 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SMARCD1Q96GM5 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SMARCD1Q96GM5 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SMARCD1Q96GM5 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SMARCD1Q96GM5 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SMARCD1Q96GM5 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SMARCD1Q96GM5 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SMARCD1Q96GM5 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SMARCD1Q96GM5 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SMARCD1Q96GM5 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SMARCD1Q96GM5 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SMARCD1Q96GM5 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SMARCD1Q96GM5 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SMARCD1Q96GM5 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SMARCD1Q96GM5 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SMARCD1Q96GM5 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SMARCD1Q96GM5 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SMARCD1Q96GM5 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SMARCD1Q96GM5 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SMARCD1Q96GM5 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SMARCD1Q96GM5 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SMARCD1Q96GM5 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SMARCD1Q96GM5 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SMARCD1Q96GM5 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SMARCD1Q96GM5 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SMARCD1Q96GM5 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SMARCD1Q96GM5 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SMARCD1Q96GM5 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SMARCD1Q96GM5 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SMARCD1Q96GM5 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SMARCD1Q96GM5 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SMARCD1Q96GM5 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SMARCD1Q96GM5 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SMARCD1Q96GM5 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SMARCD1Q96GM5 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SMARCD1Q96GM5 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SMARCD1Q96GM5 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SMARCD1Q96GM5 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SMARCD1Q96GM5 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SMARCD1Q96GM5 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
SMARCD1Q96GM5 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SMARCD1Q96GM5 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SMARCD1Q96GM5 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SMARCD1Q96GM5 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SMARCD1Q96GM5 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SMARCD1Q96GM5 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SMARCD1Q96GM5 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SMARCD1Q96GM5 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SMARCD1Q96GM5 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SMARCD1Q96GM5 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SMARCD1Q96GM5 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SMARCD1Q96GM5 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SMARCD1Q96GM5 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SMARCD1Q96GM5 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SMARCD1Q96GM5 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SMARCD1Q96GM5 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SMARCD1Q96GM5 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SMARCD1Q96GM5 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SMARCD1Q96GM5 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SMARCD1Q96GM5 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SMARCD1Q96GM5 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SMARCD1Q96GM5 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SMARCD1Q96GM5 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SMARCD1Q96GM5 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SMARCD1Q96GM5 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SMARCD1Q96GM5 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SMARCD1Q96GM5 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SMARCD1Q96GM5 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SMARCD1Q96GM5 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SMARCD1Q96GM5 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SMARCD1Q96GM5 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SMARCD1Q96GM5 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SMARCD1Q96GM5 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SMARCD1Q96GM5 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SMARCD1Q96GM5 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms