Protein–RNA interactions for Protein: Q96GA3

LTV1, Protein LTV1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTV1Q96GA3 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC32.57■■■□□ 2.8
LTV1Q96GA3 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC32.57■■■□□ 2.8
LTV1Q96GA3 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC32.57■■■□□ 2.8
LTV1Q96GA3 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
LTV1Q96GA3 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
LTV1Q96GA3 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
LTV1Q96GA3 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
LTV1Q96GA3 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
LTV1Q96GA3 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
LTV1Q96GA3 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
LTV1Q96GA3 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
LTV1Q96GA3 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
LTV1Q96GA3 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
LTV1Q96GA3 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
LTV1Q96GA3 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
LTV1Q96GA3 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
LTV1Q96GA3 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
LTV1Q96GA3 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
LTV1Q96GA3 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
LTV1Q96GA3 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
LTV1Q96GA3 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
LTV1Q96GA3 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
LTV1Q96GA3 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
LTV1Q96GA3 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
LTV1Q96GA3 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
LTV1Q96GA3 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
LTV1Q96GA3 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
LTV1Q96GA3 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.53■■■□□ 2.8
LTV1Q96GA3 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
LTV1Q96GA3 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.52■■■□□ 2.8
LTV1Q96GA3 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC32.52■■■□□ 2.8
LTV1Q96GA3 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
LTV1Q96GA3 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.8
LTV1Q96GA3 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
LTV1Q96GA3 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC32.51■■■□□ 2.79
LTV1Q96GA3 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC32.51■■■□□ 2.79
LTV1Q96GA3 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
LTV1Q96GA3 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
LTV1Q96GA3 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC32.5■■■□□ 2.79
LTV1Q96GA3 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
LTV1Q96GA3 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
LTV1Q96GA3 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
LTV1Q96GA3 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
LTV1Q96GA3 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
LTV1Q96GA3 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
LTV1Q96GA3 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
LTV1Q96GA3 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
LTV1Q96GA3 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
LTV1Q96GA3 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
LTV1Q96GA3 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
LTV1Q96GA3 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
LTV1Q96GA3 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC32.47■■■□□ 2.79
LTV1Q96GA3 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
LTV1Q96GA3 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
LTV1Q96GA3 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
LTV1Q96GA3 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
LTV1Q96GA3 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
LTV1Q96GA3 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
LTV1Q96GA3 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
LTV1Q96GA3 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
LTV1Q96GA3 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.79
LTV1Q96GA3 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
LTV1Q96GA3 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
LTV1Q96GA3 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
LTV1Q96GA3 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
LTV1Q96GA3 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC32.44■■■□□ 2.78
LTV1Q96GA3 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
LTV1Q96GA3 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
LTV1Q96GA3 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
LTV1Q96GA3 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
LTV1Q96GA3 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
LTV1Q96GA3 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
LTV1Q96GA3 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
LTV1Q96GA3 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
LTV1Q96GA3 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
LTV1Q96GA3 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
LTV1Q96GA3 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
LTV1Q96GA3 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
LTV1Q96GA3 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
LTV1Q96GA3 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
LTV1Q96GA3 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
LTV1Q96GA3 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
LTV1Q96GA3 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
LTV1Q96GA3 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
LTV1Q96GA3 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
LTV1Q96GA3 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
LTV1Q96GA3 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
LTV1Q96GA3 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
LTV1Q96GA3 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
LTV1Q96GA3 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
LTV1Q96GA3 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
LTV1Q96GA3 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
LTV1Q96GA3 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
LTV1Q96GA3 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC32.37■■■□□ 2.77
LTV1Q96GA3 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
LTV1Q96GA3 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
LTV1Q96GA3 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
LTV1Q96GA3 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
LTV1Q96GA3 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
LTV1Q96GA3 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms