Protein–RNA interactions for Protein: Q96FE7

PIK3IP1, Phosphoinositide-3-kinase-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3IP1Q96FE7 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PIK3IP1Q96FE7 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PIK3IP1Q96FE7 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PIK3IP1Q96FE7 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PIK3IP1Q96FE7 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PIK3IP1Q96FE7 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PIK3IP1Q96FE7 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PIK3IP1Q96FE7 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PIK3IP1Q96FE7 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PIK3IP1Q96FE7 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PIK3IP1Q96FE7 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.33■■□□□ 1
PIK3IP1Q96FE7 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PIK3IP1Q96FE7 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PIK3IP1Q96FE7 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PIK3IP1Q96FE7 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PIK3IP1Q96FE7 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PIK3IP1Q96FE7 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PIK3IP1Q96FE7 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PIK3IP1Q96FE7 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PIK3IP1Q96FE7 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PIK3IP1Q96FE7 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PIK3IP1Q96FE7 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
PIK3IP1Q96FE7 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PIK3IP1Q96FE7 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PIK3IP1Q96FE7 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PIK3IP1Q96FE7 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PIK3IP1Q96FE7 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
PIK3IP1Q96FE7 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PIK3IP1Q96FE7 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PIK3IP1Q96FE7 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PIK3IP1Q96FE7 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PIK3IP1Q96FE7 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PIK3IP1Q96FE7 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PIK3IP1Q96FE7 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PIK3IP1Q96FE7 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PIK3IP1Q96FE7 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PIK3IP1Q96FE7 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PIK3IP1Q96FE7 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PIK3IP1Q96FE7 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PIK3IP1Q96FE7 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PIK3IP1Q96FE7 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PIK3IP1Q96FE7 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PIK3IP1Q96FE7 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PIK3IP1Q96FE7 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PIK3IP1Q96FE7 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PIK3IP1Q96FE7 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PIK3IP1Q96FE7 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PIK3IP1Q96FE7 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PIK3IP1Q96FE7 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PIK3IP1Q96FE7 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PIK3IP1Q96FE7 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PIK3IP1Q96FE7 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PIK3IP1Q96FE7 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PIK3IP1Q96FE7 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PIK3IP1Q96FE7 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
PIK3IP1Q96FE7 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PIK3IP1Q96FE7 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PIK3IP1Q96FE7 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PIK3IP1Q96FE7 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PIK3IP1Q96FE7 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PIK3IP1Q96FE7 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PIK3IP1Q96FE7 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PIK3IP1Q96FE7 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PIK3IP1Q96FE7 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PIK3IP1Q96FE7 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PIK3IP1Q96FE7 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PIK3IP1Q96FE7 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PIK3IP1Q96FE7 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PIK3IP1Q96FE7 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PIK3IP1Q96FE7 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PIK3IP1Q96FE7 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PIK3IP1Q96FE7 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PIK3IP1Q96FE7 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PIK3IP1Q96FE7 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PIK3IP1Q96FE7 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PIK3IP1Q96FE7 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PIK3IP1Q96FE7 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PIK3IP1Q96FE7 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PIK3IP1Q96FE7 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PIK3IP1Q96FE7 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PIK3IP1Q96FE7 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PIK3IP1Q96FE7 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PIK3IP1Q96FE7 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PIK3IP1Q96FE7 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PIK3IP1Q96FE7 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PIK3IP1Q96FE7 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PIK3IP1Q96FE7 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PIK3IP1Q96FE7 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PIK3IP1Q96FE7 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PIK3IP1Q96FE7 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PIK3IP1Q96FE7 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PIK3IP1Q96FE7 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PIK3IP1Q96FE7 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PIK3IP1Q96FE7 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PIK3IP1Q96FE7 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PIK3IP1Q96FE7 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PIK3IP1Q96FE7 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PIK3IP1Q96FE7 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PIK3IP1Q96FE7 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PIK3IP1Q96FE7 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms