Protein–RNA interactions for Protein: Q96ET8

TVP23C, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog C, humanhuman

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TVP23CQ96ET8 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TVP23CQ96ET8 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
TVP23CQ96ET8 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TVP23CQ96ET8 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TVP23CQ96ET8 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TVP23CQ96ET8 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TVP23CQ96ET8 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TVP23CQ96ET8 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TVP23CQ96ET8 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TVP23CQ96ET8 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TVP23CQ96ET8 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TVP23CQ96ET8 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TVP23CQ96ET8 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TVP23CQ96ET8 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TVP23CQ96ET8 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TVP23CQ96ET8 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TVP23CQ96ET8 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TVP23CQ96ET8 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TVP23CQ96ET8 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TVP23CQ96ET8 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TVP23CQ96ET8 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TVP23CQ96ET8 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TVP23CQ96ET8 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TVP23CQ96ET8 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TVP23CQ96ET8 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TVP23CQ96ET8 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TVP23CQ96ET8 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TVP23CQ96ET8 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TVP23CQ96ET8 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TVP23CQ96ET8 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TVP23CQ96ET8 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TVP23CQ96ET8 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TVP23CQ96ET8 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TVP23CQ96ET8 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TVP23CQ96ET8 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TVP23CQ96ET8 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TVP23CQ96ET8 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TVP23CQ96ET8 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TVP23CQ96ET8 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TVP23CQ96ET8 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TVP23CQ96ET8 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TVP23CQ96ET8 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TVP23CQ96ET8 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TVP23CQ96ET8 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TVP23CQ96ET8 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
TVP23CQ96ET8 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TVP23CQ96ET8 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
TVP23CQ96ET8 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TVP23CQ96ET8 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TVP23CQ96ET8 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TVP23CQ96ET8 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TVP23CQ96ET8 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TVP23CQ96ET8 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TVP23CQ96ET8 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TVP23CQ96ET8 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TVP23CQ96ET8 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TVP23CQ96ET8 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TVP23CQ96ET8 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TVP23CQ96ET8 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TVP23CQ96ET8 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TVP23CQ96ET8 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TVP23CQ96ET8 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TVP23CQ96ET8 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TVP23CQ96ET8 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TVP23CQ96ET8 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TVP23CQ96ET8 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TVP23CQ96ET8 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TVP23CQ96ET8 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TVP23CQ96ET8 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TVP23CQ96ET8 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TVP23CQ96ET8 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TVP23CQ96ET8 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TVP23CQ96ET8 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TVP23CQ96ET8 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TVP23CQ96ET8 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TVP23CQ96ET8 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TVP23CQ96ET8 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
TVP23CQ96ET8 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TVP23CQ96ET8 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TVP23CQ96ET8 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TVP23CQ96ET8 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TVP23CQ96ET8 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TVP23CQ96ET8 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TVP23CQ96ET8 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TVP23CQ96ET8 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TVP23CQ96ET8 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TVP23CQ96ET8 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TVP23CQ96ET8 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TVP23CQ96ET8 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TVP23CQ96ET8 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
TVP23CQ96ET8 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TVP23CQ96ET8 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TVP23CQ96ET8 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TVP23CQ96ET8 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TVP23CQ96ET8 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TVP23CQ96ET8 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
TVP23CQ96ET8 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TVP23CQ96ET8 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
TVP23CQ96ET8 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TVP23CQ96ET8 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms