Protein–RNA interactions for Protein: Q96EC8

YIPF6, Protein YIPF6, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YIPF6Q96EC8 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
YIPF6Q96EC8 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
YIPF6Q96EC8 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
YIPF6Q96EC8 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
YIPF6Q96EC8 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
YIPF6Q96EC8 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
YIPF6Q96EC8 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
YIPF6Q96EC8 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
YIPF6Q96EC8 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
YIPF6Q96EC8 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
YIPF6Q96EC8 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
YIPF6Q96EC8 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
YIPF6Q96EC8 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
YIPF6Q96EC8 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
YIPF6Q96EC8 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
YIPF6Q96EC8 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
YIPF6Q96EC8 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
YIPF6Q96EC8 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
YIPF6Q96EC8 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
YIPF6Q96EC8 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
YIPF6Q96EC8 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
YIPF6Q96EC8 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
YIPF6Q96EC8 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
YIPF6Q96EC8 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
YIPF6Q96EC8 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
YIPF6Q96EC8 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
YIPF6Q96EC8 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
YIPF6Q96EC8 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
YIPF6Q96EC8 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
YIPF6Q96EC8 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
YIPF6Q96EC8 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
YIPF6Q96EC8 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
YIPF6Q96EC8 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
YIPF6Q96EC8 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
YIPF6Q96EC8 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
YIPF6Q96EC8 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
YIPF6Q96EC8 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
YIPF6Q96EC8 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
YIPF6Q96EC8 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
YIPF6Q96EC8 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
YIPF6Q96EC8 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
YIPF6Q96EC8 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
YIPF6Q96EC8 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
YIPF6Q96EC8 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
YIPF6Q96EC8 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
YIPF6Q96EC8 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
YIPF6Q96EC8 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
YIPF6Q96EC8 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
YIPF6Q96EC8 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
YIPF6Q96EC8 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
YIPF6Q96EC8 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
YIPF6Q96EC8 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
YIPF6Q96EC8 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
YIPF6Q96EC8 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
YIPF6Q96EC8 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
YIPF6Q96EC8 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
YIPF6Q96EC8 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
YIPF6Q96EC8 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
YIPF6Q96EC8 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
YIPF6Q96EC8 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
YIPF6Q96EC8 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
YIPF6Q96EC8 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
YIPF6Q96EC8 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
YIPF6Q96EC8 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
YIPF6Q96EC8 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
YIPF6Q96EC8 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
YIPF6Q96EC8 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
YIPF6Q96EC8 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
YIPF6Q96EC8 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
YIPF6Q96EC8 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
YIPF6Q96EC8 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
YIPF6Q96EC8 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
YIPF6Q96EC8 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
YIPF6Q96EC8 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
YIPF6Q96EC8 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
YIPF6Q96EC8 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
YIPF6Q96EC8 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
YIPF6Q96EC8 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
YIPF6Q96EC8 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
YIPF6Q96EC8 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
YIPF6Q96EC8 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
YIPF6Q96EC8 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
YIPF6Q96EC8 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
YIPF6Q96EC8 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
YIPF6Q96EC8 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
YIPF6Q96EC8 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
YIPF6Q96EC8 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
YIPF6Q96EC8 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
YIPF6Q96EC8 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
YIPF6Q96EC8 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
YIPF6Q96EC8 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
YIPF6Q96EC8 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
YIPF6Q96EC8 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
YIPF6Q96EC8 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
YIPF6Q96EC8 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
YIPF6Q96EC8 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
YIPF6Q96EC8 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
YIPF6Q96EC8 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
YIPF6Q96EC8 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
YIPF6Q96EC8 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms