Protein–RNA interactions for Protein: Q96CW6

SLC7A6OS, Probable RNA polymerase II nuclear localization protein SLC7A6OS, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC7A6OSQ96CW6 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC7A6OSQ96CW6 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC7A6OSQ96CW6 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC7A6OSQ96CW6 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC7A6OSQ96CW6 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC7A6OSQ96CW6 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC7A6OSQ96CW6 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC7A6OSQ96CW6 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC7A6OSQ96CW6 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC7A6OSQ96CW6 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC7A6OSQ96CW6 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC7A6OSQ96CW6 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC7A6OSQ96CW6 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC7A6OSQ96CW6 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC7A6OSQ96CW6 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC7A6OSQ96CW6 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC7A6OSQ96CW6 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC7A6OSQ96CW6 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC7A6OSQ96CW6 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC7A6OSQ96CW6 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC7A6OSQ96CW6 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC7A6OSQ96CW6 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC7A6OSQ96CW6 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC7A6OSQ96CW6 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC7A6OSQ96CW6 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC7A6OSQ96CW6 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC7A6OSQ96CW6 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC7A6OSQ96CW6 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC7A6OSQ96CW6 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC7A6OSQ96CW6 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC7A6OSQ96CW6 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC7A6OSQ96CW6 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC7A6OSQ96CW6 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC7A6OSQ96CW6 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC7A6OSQ96CW6 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC7A6OSQ96CW6 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC7A6OSQ96CW6 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC7A6OSQ96CW6 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC7A6OSQ96CW6 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC7A6OSQ96CW6 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC7A6OSQ96CW6 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC7A6OSQ96CW6 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC7A6OSQ96CW6 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC7A6OSQ96CW6 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC7A6OSQ96CW6 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC7A6OSQ96CW6 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC7A6OSQ96CW6 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC7A6OSQ96CW6 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC7A6OSQ96CW6 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC7A6OSQ96CW6 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC7A6OSQ96CW6 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC7A6OSQ96CW6 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC7A6OSQ96CW6 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SLC7A6OSQ96CW6 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC7A6OSQ96CW6 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC7A6OSQ96CW6 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC7A6OSQ96CW6 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC7A6OSQ96CW6 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC7A6OSQ96CW6 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC7A6OSQ96CW6 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC7A6OSQ96CW6 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC7A6OSQ96CW6 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC7A6OSQ96CW6 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC7A6OSQ96CW6 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC7A6OSQ96CW6 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC7A6OSQ96CW6 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC7A6OSQ96CW6 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC7A6OSQ96CW6 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC7A6OSQ96CW6 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC7A6OSQ96CW6 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC7A6OSQ96CW6 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC7A6OSQ96CW6 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC7A6OSQ96CW6 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC7A6OSQ96CW6 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC7A6OSQ96CW6 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC7A6OSQ96CW6 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC7A6OSQ96CW6 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC7A6OSQ96CW6 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC7A6OSQ96CW6 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC7A6OSQ96CW6 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC7A6OSQ96CW6 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC7A6OSQ96CW6 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC7A6OSQ96CW6 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC7A6OSQ96CW6 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC7A6OSQ96CW6 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC7A6OSQ96CW6 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC7A6OSQ96CW6 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC7A6OSQ96CW6 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC7A6OSQ96CW6 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC7A6OSQ96CW6 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC7A6OSQ96CW6 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC7A6OSQ96CW6 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC7A6OSQ96CW6 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC7A6OSQ96CW6 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC7A6OSQ96CW6 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC7A6OSQ96CW6 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC7A6OSQ96CW6 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC7A6OSQ96CW6 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC7A6OSQ96CW6 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC7A6OSQ96CW6 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 140.5 ms