Protein–RNA interactions for Protein: Q96CT2

KLHL29, Kelch-like protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL29Q96CT2 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
KLHL29Q96CT2 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KLHL29Q96CT2 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KLHL29Q96CT2 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KLHL29Q96CT2 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KLHL29Q96CT2 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KLHL29Q96CT2 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KLHL29Q96CT2 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KLHL29Q96CT2 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KLHL29Q96CT2 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KLHL29Q96CT2 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KLHL29Q96CT2 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KLHL29Q96CT2 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KLHL29Q96CT2 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KLHL29Q96CT2 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KLHL29Q96CT2 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KLHL29Q96CT2 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KLHL29Q96CT2 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KLHL29Q96CT2 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KLHL29Q96CT2 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KLHL29Q96CT2 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KLHL29Q96CT2 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KLHL29Q96CT2 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KLHL29Q96CT2 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KLHL29Q96CT2 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KLHL29Q96CT2 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KLHL29Q96CT2 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KLHL29Q96CT2 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KLHL29Q96CT2 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KLHL29Q96CT2 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KLHL29Q96CT2 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KLHL29Q96CT2 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KLHL29Q96CT2 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KLHL29Q96CT2 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KLHL29Q96CT2 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KLHL29Q96CT2 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KLHL29Q96CT2 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KLHL29Q96CT2 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KLHL29Q96CT2 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KLHL29Q96CT2 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KLHL29Q96CT2 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KLHL29Q96CT2 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KLHL29Q96CT2 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KLHL29Q96CT2 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KLHL29Q96CT2 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KLHL29Q96CT2 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KLHL29Q96CT2 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
KLHL29Q96CT2 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KLHL29Q96CT2 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KLHL29Q96CT2 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KLHL29Q96CT2 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KLHL29Q96CT2 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KLHL29Q96CT2 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KLHL29Q96CT2 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KLHL29Q96CT2 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KLHL29Q96CT2 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KLHL29Q96CT2 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KLHL29Q96CT2 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KLHL29Q96CT2 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KLHL29Q96CT2 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
KLHL29Q96CT2 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KLHL29Q96CT2 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KLHL29Q96CT2 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KLHL29Q96CT2 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KLHL29Q96CT2 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KLHL29Q96CT2 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
KLHL29Q96CT2 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
KLHL29Q96CT2 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
KLHL29Q96CT2 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
KLHL29Q96CT2 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
KLHL29Q96CT2 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
KLHL29Q96CT2 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
KLHL29Q96CT2 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KLHL29Q96CT2 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KLHL29Q96CT2 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KLHL29Q96CT2 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
KLHL29Q96CT2 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
KLHL29Q96CT2 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KLHL29Q96CT2 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
KLHL29Q96CT2 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
KLHL29Q96CT2 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KLHL29Q96CT2 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KLHL29Q96CT2 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KLHL29Q96CT2 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KLHL29Q96CT2 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KLHL29Q96CT2 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KLHL29Q96CT2 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KLHL29Q96CT2 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KLHL29Q96CT2 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KLHL29Q96CT2 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KLHL29Q96CT2 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KLHL29Q96CT2 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KLHL29Q96CT2 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KLHL29Q96CT2 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KLHL29Q96CT2 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KLHL29Q96CT2 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KLHL29Q96CT2 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KLHL29Q96CT2 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KLHL29Q96CT2 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
KLHL29Q96CT2 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms