Protein–RNA interactions for Protein: Q96AQ1

CCDC74A, Coiled-coil domain-containing protein 74A, humanhuman

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Length 378 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC74AQ96AQ1 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC74AQ96AQ1 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC74AQ96AQ1 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC74AQ96AQ1 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC74AQ96AQ1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC74AQ96AQ1 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC74AQ96AQ1 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC74AQ96AQ1 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC74AQ96AQ1 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC74AQ96AQ1 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC74AQ96AQ1 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC74AQ96AQ1 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC74AQ96AQ1 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC74AQ96AQ1 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC74AQ96AQ1 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC74AQ96AQ1 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC74AQ96AQ1 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC74AQ96AQ1 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC74AQ96AQ1 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC74AQ96AQ1 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC74AQ96AQ1 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC74AQ96AQ1 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC74AQ96AQ1 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC74AQ96AQ1 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC74AQ96AQ1 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC74AQ96AQ1 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC74AQ96AQ1 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC74AQ96AQ1 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC74AQ96AQ1 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC74AQ96AQ1 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC74AQ96AQ1 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC74AQ96AQ1 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC74AQ96AQ1 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC74AQ96AQ1 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC74AQ96AQ1 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC74AQ96AQ1 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC74AQ96AQ1 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC74AQ96AQ1 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC74AQ96AQ1 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC74AQ96AQ1 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC74AQ96AQ1 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCDC74AQ96AQ1 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCDC74AQ96AQ1 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC74AQ96AQ1 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC74AQ96AQ1 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC74AQ96AQ1 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC74AQ96AQ1 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC74AQ96AQ1 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC74AQ96AQ1 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC74AQ96AQ1 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC74AQ96AQ1 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC74AQ96AQ1 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC74AQ96AQ1 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC74AQ96AQ1 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC74AQ96AQ1 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC74AQ96AQ1 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC74AQ96AQ1 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC74AQ96AQ1 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC74AQ96AQ1 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC74AQ96AQ1 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC74AQ96AQ1 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC74AQ96AQ1 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC74AQ96AQ1 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC74AQ96AQ1 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC74AQ96AQ1 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC74AQ96AQ1 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC74AQ96AQ1 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC74AQ96AQ1 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC74AQ96AQ1 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC74AQ96AQ1 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC74AQ96AQ1 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC74AQ96AQ1 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC74AQ96AQ1 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC74AQ96AQ1 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC74AQ96AQ1 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC74AQ96AQ1 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC74AQ96AQ1 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC74AQ96AQ1 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC74AQ96AQ1 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC74AQ96AQ1 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC74AQ96AQ1 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC74AQ96AQ1 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC74AQ96AQ1 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC74AQ96AQ1 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC74AQ96AQ1 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC74AQ96AQ1 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC74AQ96AQ1 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC74AQ96AQ1 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC74AQ96AQ1 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC74AQ96AQ1 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC74AQ96AQ1 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC74AQ96AQ1 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC74AQ96AQ1 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC74AQ96AQ1 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC74AQ96AQ1 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC74AQ96AQ1 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC74AQ96AQ1 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC74AQ96AQ1 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC74AQ96AQ1 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC74AQ96AQ1 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
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