Protein–RNA interactions for Protein: Q96AQ1

CCDC74A, Coiled-coil domain-containing protein 74A, humanhuman

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Length 378 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC74AQ96AQ1 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC33.5■■■□□ 2.95
CCDC74AQ96AQ1 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC32.87■■■□□ 2.85
CCDC74AQ96AQ1 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
CCDC74AQ96AQ1 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
CCDC74AQ96AQ1 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
CCDC74AQ96AQ1 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.34■■■□□ 2.77
CCDC74AQ96AQ1 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.77
CCDC74AQ96AQ1 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
CCDC74AQ96AQ1 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
CCDC74AQ96AQ1 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC31.39■■■□□ 2.62
CCDC74AQ96AQ1 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
CCDC74AQ96AQ1 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
CCDC74AQ96AQ1 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC31.32■■■□□ 2.6
CCDC74AQ96AQ1 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
CCDC74AQ96AQ1 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
CCDC74AQ96AQ1 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
CCDC74AQ96AQ1 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
CCDC74AQ96AQ1 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
CCDC74AQ96AQ1 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
CCDC74AQ96AQ1 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
CCDC74AQ96AQ1 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
CCDC74AQ96AQ1 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
CCDC74AQ96AQ1 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
CCDC74AQ96AQ1 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
CCDC74AQ96AQ1 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
CCDC74AQ96AQ1 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
CCDC74AQ96AQ1 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
CCDC74AQ96AQ1 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
CCDC74AQ96AQ1 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
CCDC74AQ96AQ1 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
CCDC74AQ96AQ1 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CCDC74AQ96AQ1 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CCDC74AQ96AQ1 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
CCDC74AQ96AQ1 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CCDC74AQ96AQ1 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CCDC74AQ96AQ1 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CCDC74AQ96AQ1 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
CCDC74AQ96AQ1 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CCDC74AQ96AQ1 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
CCDC74AQ96AQ1 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CCDC74AQ96AQ1 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CCDC74AQ96AQ1 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
CCDC74AQ96AQ1 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CCDC74AQ96AQ1 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CCDC74AQ96AQ1 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CCDC74AQ96AQ1 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CCDC74AQ96AQ1 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CCDC74AQ96AQ1 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CCDC74AQ96AQ1 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CCDC74AQ96AQ1 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CCDC74AQ96AQ1 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CCDC74AQ96AQ1 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC74AQ96AQ1 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC74AQ96AQ1 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC74AQ96AQ1 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC74AQ96AQ1 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCDC74AQ96AQ1 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC74AQ96AQ1 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCDC74AQ96AQ1 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCDC74AQ96AQ1 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCDC74AQ96AQ1 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC74AQ96AQ1 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC74AQ96AQ1 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCDC74AQ96AQ1 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC74AQ96AQ1 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC74AQ96AQ1 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CCDC74AQ96AQ1 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CCDC74AQ96AQ1 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CCDC74AQ96AQ1 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC74AQ96AQ1 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC74AQ96AQ1 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC74AQ96AQ1 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC74AQ96AQ1 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC74AQ96AQ1 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC74AQ96AQ1 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC74AQ96AQ1 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC74AQ96AQ1 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC74AQ96AQ1 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC74AQ96AQ1 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCDC74AQ96AQ1 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCDC74AQ96AQ1 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CCDC74AQ96AQ1 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCDC74AQ96AQ1 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCDC74AQ96AQ1 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCDC74AQ96AQ1 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCDC74AQ96AQ1 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC74AQ96AQ1 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC74AQ96AQ1 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC74AQ96AQ1 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC74AQ96AQ1 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC74AQ96AQ1 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC74AQ96AQ1 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCDC74AQ96AQ1 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC74AQ96AQ1 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC74AQ96AQ1 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CCDC74AQ96AQ1 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CCDC74AQ96AQ1 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC74AQ96AQ1 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CCDC74AQ96AQ1 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC74AQ96AQ1 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
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