Protein–RNA interactions for Protein: Q92544

TM9SF4, Transmembrane 9 superfamily member 4, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM9SF4Q92544 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TM9SF4Q92544 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TM9SF4Q92544 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TM9SF4Q92544 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TM9SF4Q92544 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TM9SF4Q92544 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TM9SF4Q92544 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TM9SF4Q92544 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TM9SF4Q92544 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TM9SF4Q92544 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TM9SF4Q92544 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TM9SF4Q92544 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TM9SF4Q92544 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TM9SF4Q92544 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TM9SF4Q92544 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TM9SF4Q92544 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TM9SF4Q92544 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TM9SF4Q92544 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TM9SF4Q92544 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TM9SF4Q92544 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TM9SF4Q92544 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TM9SF4Q92544 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TM9SF4Q92544 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TM9SF4Q92544 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TM9SF4Q92544 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TM9SF4Q92544 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TM9SF4Q92544 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TM9SF4Q92544 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TM9SF4Q92544 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TM9SF4Q92544 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TM9SF4Q92544 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TM9SF4Q92544 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TM9SF4Q92544 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TM9SF4Q92544 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TM9SF4Q92544 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TM9SF4Q92544 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TM9SF4Q92544 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TM9SF4Q92544 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TM9SF4Q92544 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TM9SF4Q92544 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TM9SF4Q92544 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TM9SF4Q92544 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TM9SF4Q92544 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TM9SF4Q92544 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TM9SF4Q92544 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TM9SF4Q92544 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TM9SF4Q92544 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TM9SF4Q92544 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TM9SF4Q92544 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TM9SF4Q92544 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TM9SF4Q92544 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TM9SF4Q92544 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TM9SF4Q92544 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TM9SF4Q92544 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TM9SF4Q92544 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TM9SF4Q92544 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TM9SF4Q92544 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TM9SF4Q92544 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TM9SF4Q92544 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TM9SF4Q92544 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TM9SF4Q92544 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TM9SF4Q92544 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TM9SF4Q92544 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TM9SF4Q92544 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TM9SF4Q92544 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TM9SF4Q92544 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TM9SF4Q92544 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TM9SF4Q92544 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TM9SF4Q92544 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TM9SF4Q92544 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TM9SF4Q92544 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TM9SF4Q92544 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TM9SF4Q92544 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TM9SF4Q92544 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TM9SF4Q92544 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TM9SF4Q92544 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TM9SF4Q92544 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TM9SF4Q92544 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TM9SF4Q92544 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TM9SF4Q92544 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TM9SF4Q92544 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TM9SF4Q92544 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TM9SF4Q92544 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TM9SF4Q92544 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TM9SF4Q92544 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TM9SF4Q92544 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TM9SF4Q92544 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TM9SF4Q92544 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TM9SF4Q92544 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TM9SF4Q92544 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TM9SF4Q92544 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TM9SF4Q92544 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TM9SF4Q92544 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TM9SF4Q92544 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TM9SF4Q92544 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TM9SF4Q92544 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TM9SF4Q92544 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TM9SF4Q92544 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TM9SF4Q92544 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TM9SF4Q92544 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms