Protein–RNA interactions for Protein: Q8NG50

RDM1, RAD52 motif-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDM1Q8NG50 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RDM1Q8NG50 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RDM1Q8NG50 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RDM1Q8NG50 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RDM1Q8NG50 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RDM1Q8NG50 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RDM1Q8NG50 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RDM1Q8NG50 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RDM1Q8NG50 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
RDM1Q8NG50 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RDM1Q8NG50 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RDM1Q8NG50 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RDM1Q8NG50 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RDM1Q8NG50 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RDM1Q8NG50 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RDM1Q8NG50 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RDM1Q8NG50 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RDM1Q8NG50 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RDM1Q8NG50 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RDM1Q8NG50 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
RDM1Q8NG50 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RDM1Q8NG50 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RDM1Q8NG50 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RDM1Q8NG50 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RDM1Q8NG50 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RDM1Q8NG50 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RDM1Q8NG50 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RDM1Q8NG50 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RDM1Q8NG50 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RDM1Q8NG50 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RDM1Q8NG50 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RDM1Q8NG50 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RDM1Q8NG50 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RDM1Q8NG50 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RDM1Q8NG50 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RDM1Q8NG50 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RDM1Q8NG50 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RDM1Q8NG50 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RDM1Q8NG50 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RDM1Q8NG50 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RDM1Q8NG50 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RDM1Q8NG50 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RDM1Q8NG50 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RDM1Q8NG50 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RDM1Q8NG50 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RDM1Q8NG50 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RDM1Q8NG50 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RDM1Q8NG50 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
RDM1Q8NG50 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RDM1Q8NG50 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RDM1Q8NG50 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RDM1Q8NG50 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RDM1Q8NG50 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RDM1Q8NG50 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RDM1Q8NG50 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RDM1Q8NG50 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RDM1Q8NG50 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RDM1Q8NG50 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RDM1Q8NG50 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RDM1Q8NG50 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RDM1Q8NG50 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RDM1Q8NG50 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RDM1Q8NG50 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RDM1Q8NG50 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RDM1Q8NG50 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RDM1Q8NG50 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RDM1Q8NG50 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RDM1Q8NG50 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RDM1Q8NG50 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RDM1Q8NG50 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
RDM1Q8NG50 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RDM1Q8NG50 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
RDM1Q8NG50 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RDM1Q8NG50 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RDM1Q8NG50 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RDM1Q8NG50 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RDM1Q8NG50 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RDM1Q8NG50 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RDM1Q8NG50 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RDM1Q8NG50 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
RDM1Q8NG50 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RDM1Q8NG50 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27■■□□□ 1.91
RDM1Q8NG50 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27■■□□□ 1.91
RDM1Q8NG50 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RDM1Q8NG50 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RDM1Q8NG50 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
RDM1Q8NG50 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RDM1Q8NG50 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RDM1Q8NG50 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RDM1Q8NG50 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RDM1Q8NG50 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RDM1Q8NG50 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RDM1Q8NG50 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RDM1Q8NG50 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RDM1Q8NG50 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RDM1Q8NG50 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RDM1Q8NG50 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
RDM1Q8NG50 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RDM1Q8NG50 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RDM1Q8NG50 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.4 ms