Protein–RNA interactions for Protein: Q8NER1

TRPV1, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 1, humanhuman

Predictions only

Length 839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPV1Q8NER1 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRPV1Q8NER1 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRPV1Q8NER1 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRPV1Q8NER1 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRPV1Q8NER1 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRPV1Q8NER1 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRPV1Q8NER1 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRPV1Q8NER1 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
TRPV1Q8NER1 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
TRPV1Q8NER1 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
TRPV1Q8NER1 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRPV1Q8NER1 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRPV1Q8NER1 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRPV1Q8NER1 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRPV1Q8NER1 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRPV1Q8NER1 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
TRPV1Q8NER1 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRPV1Q8NER1 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRPV1Q8NER1 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRPV1Q8NER1 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRPV1Q8NER1 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TRPV1Q8NER1 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TRPV1Q8NER1 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TRPV1Q8NER1 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRPV1Q8NER1 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRPV1Q8NER1 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRPV1Q8NER1 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRPV1Q8NER1 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRPV1Q8NER1 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRPV1Q8NER1 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRPV1Q8NER1 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRPV1Q8NER1 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRPV1Q8NER1 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRPV1Q8NER1 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
TRPV1Q8NER1 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRPV1Q8NER1 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRPV1Q8NER1 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRPV1Q8NER1 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TRPV1Q8NER1 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TRPV1Q8NER1 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TRPV1Q8NER1 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TRPV1Q8NER1 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TRPV1Q8NER1 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRPV1Q8NER1 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRPV1Q8NER1 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRPV1Q8NER1 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRPV1Q8NER1 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
TRPV1Q8NER1 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRPV1Q8NER1 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRPV1Q8NER1 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRPV1Q8NER1 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRPV1Q8NER1 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TRPV1Q8NER1 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TRPV1Q8NER1 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRPV1Q8NER1 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRPV1Q8NER1 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRPV1Q8NER1 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRPV1Q8NER1 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRPV1Q8NER1 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRPV1Q8NER1 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
TRPV1Q8NER1 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRPV1Q8NER1 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRPV1Q8NER1 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRPV1Q8NER1 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRPV1Q8NER1 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRPV1Q8NER1 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRPV1Q8NER1 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
TRPV1Q8NER1 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRPV1Q8NER1 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRPV1Q8NER1 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRPV1Q8NER1 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRPV1Q8NER1 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRPV1Q8NER1 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
TRPV1Q8NER1 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRPV1Q8NER1 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRPV1Q8NER1 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRPV1Q8NER1 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRPV1Q8NER1 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRPV1Q8NER1 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRPV1Q8NER1 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRPV1Q8NER1 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRPV1Q8NER1 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
TRPV1Q8NER1 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TRPV1Q8NER1 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TRPV1Q8NER1 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TRPV1Q8NER1 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRPV1Q8NER1 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRPV1Q8NER1 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRPV1Q8NER1 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRPV1Q8NER1 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRPV1Q8NER1 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
TRPV1Q8NER1 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRPV1Q8NER1 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRPV1Q8NER1 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRPV1Q8NER1 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRPV1Q8NER1 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRPV1Q8NER1 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
TRPV1Q8NER1 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TRPV1Q8NER1 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TRPV1Q8NER1 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms