Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK8

FAM46D, Putative nucleotidyltransferase FAM46D, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM46DQ8NEK8 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FAM46DQ8NEK8 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FAM46DQ8NEK8 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FAM46DQ8NEK8 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FAM46DQ8NEK8 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FAM46DQ8NEK8 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FAM46DQ8NEK8 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FAM46DQ8NEK8 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FAM46DQ8NEK8 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FAM46DQ8NEK8 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FAM46DQ8NEK8 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FAM46DQ8NEK8 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FAM46DQ8NEK8 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FAM46DQ8NEK8 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FAM46DQ8NEK8 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
FAM46DQ8NEK8 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FAM46DQ8NEK8 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FAM46DQ8NEK8 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FAM46DQ8NEK8 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FAM46DQ8NEK8 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FAM46DQ8NEK8 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FAM46DQ8NEK8 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FAM46DQ8NEK8 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FAM46DQ8NEK8 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FAM46DQ8NEK8 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FAM46DQ8NEK8 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FAM46DQ8NEK8 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FAM46DQ8NEK8 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FAM46DQ8NEK8 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FAM46DQ8NEK8 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
FAM46DQ8NEK8 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FAM46DQ8NEK8 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FAM46DQ8NEK8 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FAM46DQ8NEK8 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
FAM46DQ8NEK8 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FAM46DQ8NEK8 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FAM46DQ8NEK8 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FAM46DQ8NEK8 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FAM46DQ8NEK8 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FAM46DQ8NEK8 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FAM46DQ8NEK8 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FAM46DQ8NEK8 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FAM46DQ8NEK8 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FAM46DQ8NEK8 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FAM46DQ8NEK8 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FAM46DQ8NEK8 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FAM46DQ8NEK8 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FAM46DQ8NEK8 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
FAM46DQ8NEK8 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FAM46DQ8NEK8 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FAM46DQ8NEK8 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FAM46DQ8NEK8 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
FAM46DQ8NEK8 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FAM46DQ8NEK8 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FAM46DQ8NEK8 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FAM46DQ8NEK8 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FAM46DQ8NEK8 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FAM46DQ8NEK8 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FAM46DQ8NEK8 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FAM46DQ8NEK8 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FAM46DQ8NEK8 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
FAM46DQ8NEK8 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FAM46DQ8NEK8 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
FAM46DQ8NEK8 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FAM46DQ8NEK8 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
FAM46DQ8NEK8 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FAM46DQ8NEK8 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FAM46DQ8NEK8 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FAM46DQ8NEK8 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FAM46DQ8NEK8 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FAM46DQ8NEK8 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FAM46DQ8NEK8 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FAM46DQ8NEK8 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FAM46DQ8NEK8 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FAM46DQ8NEK8 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
FAM46DQ8NEK8 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FAM46DQ8NEK8 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FAM46DQ8NEK8 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FAM46DQ8NEK8 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FAM46DQ8NEK8 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FAM46DQ8NEK8 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FAM46DQ8NEK8 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FAM46DQ8NEK8 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
FAM46DQ8NEK8 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FAM46DQ8NEK8 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FAM46DQ8NEK8 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FAM46DQ8NEK8 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FAM46DQ8NEK8 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FAM46DQ8NEK8 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
FAM46DQ8NEK8 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FAM46DQ8NEK8 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
FAM46DQ8NEK8 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
FAM46DQ8NEK8 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
FAM46DQ8NEK8 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
FAM46DQ8NEK8 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
FAM46DQ8NEK8 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FAM46DQ8NEK8 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FAM46DQ8NEK8 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
FAM46DQ8NEK8 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FAM46DQ8NEK8 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms