Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3P4

VPS8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS8Q8N3P4 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC38.34■■■■□ 3.73
VPS8Q8N3P4 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
VPS8Q8N3P4 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
VPS8Q8N3P4 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC38.33■■■■□ 3.73
VPS8Q8N3P4 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC38.32■■■■□ 3.73
VPS8Q8N3P4 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.73
VPS8Q8N3P4 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC38.32■■■■□ 3.73
VPS8Q8N3P4 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.73
VPS8Q8N3P4 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
VPS8Q8N3P4 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
VPS8Q8N3P4 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
VPS8Q8N3P4 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.31■■■■□ 3.72
VPS8Q8N3P4 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC38.31■■■■□ 3.72
VPS8Q8N3P4 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
VPS8Q8N3P4 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
VPS8Q8N3P4 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
VPS8Q8N3P4 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
VPS8Q8N3P4 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
VPS8Q8N3P4 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
VPS8Q8N3P4 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
VPS8Q8N3P4 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC38.29■■■■□ 3.72
VPS8Q8N3P4 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC38.29■■■■□ 3.72
VPS8Q8N3P4 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.29■■■■□ 3.72
VPS8Q8N3P4 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.29■■■■□ 3.72
VPS8Q8N3P4 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
VPS8Q8N3P4 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC38.29■■■■□ 3.72
VPS8Q8N3P4 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
VPS8Q8N3P4 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC38.29■■■■□ 3.72
VPS8Q8N3P4 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC38.28■■■■□ 3.72
VPS8Q8N3P4 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
VPS8Q8N3P4 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
VPS8Q8N3P4 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.28■■■■□ 3.72
VPS8Q8N3P4 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC38.27■■■■□ 3.72
VPS8Q8N3P4 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
VPS8Q8N3P4 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
VPS8Q8N3P4 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.26■■■■□ 3.72
VPS8Q8N3P4 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC38.26■■■■□ 3.72
VPS8Q8N3P4 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
VPS8Q8N3P4 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
VPS8Q8N3P4 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC38.26■■■■□ 3.72
VPS8Q8N3P4 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.26■■■■□ 3.72
VPS8Q8N3P4 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.71
VPS8Q8N3P4 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
VPS8Q8N3P4 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC38.25■■■■□ 3.71
VPS8Q8N3P4 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC38.24■■■■□ 3.71
VPS8Q8N3P4 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC38.24■■■■□ 3.71
VPS8Q8N3P4 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
VPS8Q8N3P4 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
VPS8Q8N3P4 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
VPS8Q8N3P4 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
VPS8Q8N3P4 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
VPS8Q8N3P4 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC38.23■■■■□ 3.71
VPS8Q8N3P4 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
VPS8Q8N3P4 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.23■■■■□ 3.71
VPS8Q8N3P4 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.22■■■■□ 3.71
VPS8Q8N3P4 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC38.22■■■■□ 3.71
VPS8Q8N3P4 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
VPS8Q8N3P4 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
VPS8Q8N3P4 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
VPS8Q8N3P4 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC38.21■■■■□ 3.71
VPS8Q8N3P4 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
VPS8Q8N3P4 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.21■■■■□ 3.71
VPS8Q8N3P4 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC38.21■■■■□ 3.71
VPS8Q8N3P4 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
VPS8Q8N3P4 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
VPS8Q8N3P4 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC38.2■■■■□ 3.71
VPS8Q8N3P4 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.19■■■■□ 3.7
VPS8Q8N3P4 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC38.18■■■■□ 3.7
VPS8Q8N3P4 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC38.18■■■■□ 3.7
VPS8Q8N3P4 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
VPS8Q8N3P4 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
VPS8Q8N3P4 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC38.17■■■■□ 3.7
VPS8Q8N3P4 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
VPS8Q8N3P4 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.16■■■■□ 3.7
VPS8Q8N3P4 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
VPS8Q8N3P4 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC38.15■■■■□ 3.7
VPS8Q8N3P4 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
VPS8Q8N3P4 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
VPS8Q8N3P4 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
VPS8Q8N3P4 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
VPS8Q8N3P4 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC38.14■■■■□ 3.7
VPS8Q8N3P4 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC38.14■■■■□ 3.7
VPS8Q8N3P4 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC38.13■■■■□ 3.69
VPS8Q8N3P4 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC38.12■■■■□ 3.69
VPS8Q8N3P4 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
VPS8Q8N3P4 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC38.12■■■■□ 3.69
VPS8Q8N3P4 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC38.12■■■■□ 3.69
VPS8Q8N3P4 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
VPS8Q8N3P4 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
VPS8Q8N3P4 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
VPS8Q8N3P4 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
VPS8Q8N3P4 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
VPS8Q8N3P4 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
VPS8Q8N3P4 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC38.1■■■■□ 3.69
VPS8Q8N3P4 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
VPS8Q8N3P4 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
VPS8Q8N3P4 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
VPS8Q8N3P4 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
VPS8Q8N3P4 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
VPS8Q8N3P4 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC38.08■■■■□ 3.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms