Protein–RNA interactions for Protein: Q8N1M1

BEST3, Bestrophin-3, humanhuman

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST3Q8N1M1 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BEST3Q8N1M1 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BEST3Q8N1M1 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BEST3Q8N1M1 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BEST3Q8N1M1 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BEST3Q8N1M1 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BEST3Q8N1M1 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BEST3Q8N1M1 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
BEST3Q8N1M1 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
BEST3Q8N1M1 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BEST3Q8N1M1 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BEST3Q8N1M1 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BEST3Q8N1M1 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BEST3Q8N1M1 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BEST3Q8N1M1 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BEST3Q8N1M1 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BEST3Q8N1M1 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BEST3Q8N1M1 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BEST3Q8N1M1 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BEST3Q8N1M1 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
BEST3Q8N1M1 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BEST3Q8N1M1 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BEST3Q8N1M1 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
BEST3Q8N1M1 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BEST3Q8N1M1 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BEST3Q8N1M1 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BEST3Q8N1M1 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BEST3Q8N1M1 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BEST3Q8N1M1 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BEST3Q8N1M1 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BEST3Q8N1M1 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BEST3Q8N1M1 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BEST3Q8N1M1 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BEST3Q8N1M1 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BEST3Q8N1M1 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BEST3Q8N1M1 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BEST3Q8N1M1 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BEST3Q8N1M1 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BEST3Q8N1M1 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BEST3Q8N1M1 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
BEST3Q8N1M1 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BEST3Q8N1M1 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BEST3Q8N1M1 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BEST3Q8N1M1 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BEST3Q8N1M1 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
BEST3Q8N1M1 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BEST3Q8N1M1 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BEST3Q8N1M1 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BEST3Q8N1M1 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BEST3Q8N1M1 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BEST3Q8N1M1 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BEST3Q8N1M1 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BEST3Q8N1M1 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BEST3Q8N1M1 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
BEST3Q8N1M1 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BEST3Q8N1M1 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BEST3Q8N1M1 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BEST3Q8N1M1 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BEST3Q8N1M1 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BEST3Q8N1M1 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BEST3Q8N1M1 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BEST3Q8N1M1 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BEST3Q8N1M1 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BEST3Q8N1M1 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BEST3Q8N1M1 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BEST3Q8N1M1 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BEST3Q8N1M1 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BEST3Q8N1M1 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BEST3Q8N1M1 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BEST3Q8N1M1 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BEST3Q8N1M1 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
BEST3Q8N1M1 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BEST3Q8N1M1 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BEST3Q8N1M1 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BEST3Q8N1M1 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BEST3Q8N1M1 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BEST3Q8N1M1 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
BEST3Q8N1M1 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BEST3Q8N1M1 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BEST3Q8N1M1 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BEST3Q8N1M1 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BEST3Q8N1M1 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BEST3Q8N1M1 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BEST3Q8N1M1 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BEST3Q8N1M1 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BEST3Q8N1M1 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
BEST3Q8N1M1 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BEST3Q8N1M1 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
BEST3Q8N1M1 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BEST3Q8N1M1 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BEST3Q8N1M1 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BEST3Q8N1M1 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BEST3Q8N1M1 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BEST3Q8N1M1 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BEST3Q8N1M1 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BEST3Q8N1M1 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BEST3Q8N1M1 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BEST3Q8N1M1 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BEST3Q8N1M1 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BEST3Q8N1M1 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms