Protein–RNA interactions for Protein: Q8N135

LGI4, Leucine-rich repeat LGI family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGI4Q8N135 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LGI4Q8N135 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LGI4Q8N135 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
LGI4Q8N135 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LGI4Q8N135 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LGI4Q8N135 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LGI4Q8N135 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LGI4Q8N135 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LGI4Q8N135 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LGI4Q8N135 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LGI4Q8N135 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LGI4Q8N135 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LGI4Q8N135 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
LGI4Q8N135 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
LGI4Q8N135 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LGI4Q8N135 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
LGI4Q8N135 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LGI4Q8N135 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LGI4Q8N135 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
LGI4Q8N135 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LGI4Q8N135 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
LGI4Q8N135 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
LGI4Q8N135 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LGI4Q8N135 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LGI4Q8N135 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LGI4Q8N135 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
LGI4Q8N135 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LGI4Q8N135 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LGI4Q8N135 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LGI4Q8N135 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LGI4Q8N135 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LGI4Q8N135 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LGI4Q8N135 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LGI4Q8N135 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LGI4Q8N135 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LGI4Q8N135 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LGI4Q8N135 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
LGI4Q8N135 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LGI4Q8N135 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LGI4Q8N135 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LGI4Q8N135 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LGI4Q8N135 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LGI4Q8N135 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LGI4Q8N135 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LGI4Q8N135 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LGI4Q8N135 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LGI4Q8N135 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LGI4Q8N135 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LGI4Q8N135 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LGI4Q8N135 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LGI4Q8N135 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LGI4Q8N135 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LGI4Q8N135 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
LGI4Q8N135 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LGI4Q8N135 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LGI4Q8N135 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LGI4Q8N135 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LGI4Q8N135 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LGI4Q8N135 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LGI4Q8N135 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LGI4Q8N135 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LGI4Q8N135 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LGI4Q8N135 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LGI4Q8N135 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LGI4Q8N135 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LGI4Q8N135 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LGI4Q8N135 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LGI4Q8N135 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LGI4Q8N135 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LGI4Q8N135 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LGI4Q8N135 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LGI4Q8N135 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LGI4Q8N135 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LGI4Q8N135 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LGI4Q8N135 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LGI4Q8N135 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LGI4Q8N135 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LGI4Q8N135 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LGI4Q8N135 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LGI4Q8N135 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LGI4Q8N135 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LGI4Q8N135 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LGI4Q8N135 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LGI4Q8N135 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LGI4Q8N135 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
LGI4Q8N135 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LGI4Q8N135 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LGI4Q8N135 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LGI4Q8N135 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LGI4Q8N135 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LGI4Q8N135 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LGI4Q8N135 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LGI4Q8N135 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
LGI4Q8N135 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
LGI4Q8N135 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LGI4Q8N135 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LGI4Q8N135 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LGI4Q8N135 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LGI4Q8N135 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LGI4Q8N135 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms