Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVH2

FOXP4, Forkhead box protein P4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXP4Q8IVH2 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
FOXP4Q8IVH2 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
FOXP4Q8IVH2 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
FOXP4Q8IVH2 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
FOXP4Q8IVH2 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
FOXP4Q8IVH2 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
FOXP4Q8IVH2 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
FOXP4Q8IVH2 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
FOXP4Q8IVH2 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
FOXP4Q8IVH2 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
FOXP4Q8IVH2 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
FOXP4Q8IVH2 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
FOXP4Q8IVH2 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
FOXP4Q8IVH2 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
FOXP4Q8IVH2 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
FOXP4Q8IVH2 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
FOXP4Q8IVH2 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
FOXP4Q8IVH2 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
FOXP4Q8IVH2 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
FOXP4Q8IVH2 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
FOXP4Q8IVH2 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
FOXP4Q8IVH2 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
FOXP4Q8IVH2 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
FOXP4Q8IVH2 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
FOXP4Q8IVH2 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
FOXP4Q8IVH2 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
FOXP4Q8IVH2 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
FOXP4Q8IVH2 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
FOXP4Q8IVH2 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
FOXP4Q8IVH2 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
FOXP4Q8IVH2 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
FOXP4Q8IVH2 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
FOXP4Q8IVH2 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
FOXP4Q8IVH2 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
FOXP4Q8IVH2 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
FOXP4Q8IVH2 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
FOXP4Q8IVH2 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
FOXP4Q8IVH2 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
FOXP4Q8IVH2 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
FOXP4Q8IVH2 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
FOXP4Q8IVH2 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
FOXP4Q8IVH2 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
FOXP4Q8IVH2 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
FOXP4Q8IVH2 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
FOXP4Q8IVH2 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
FOXP4Q8IVH2 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
FOXP4Q8IVH2 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
FOXP4Q8IVH2 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
FOXP4Q8IVH2 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
FOXP4Q8IVH2 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
FOXP4Q8IVH2 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
FOXP4Q8IVH2 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
FOXP4Q8IVH2 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
FOXP4Q8IVH2 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
FOXP4Q8IVH2 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
FOXP4Q8IVH2 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
FOXP4Q8IVH2 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
FOXP4Q8IVH2 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
FOXP4Q8IVH2 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
FOXP4Q8IVH2 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
FOXP4Q8IVH2 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
FOXP4Q8IVH2 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
FOXP4Q8IVH2 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
FOXP4Q8IVH2 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
FOXP4Q8IVH2 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
FOXP4Q8IVH2 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
FOXP4Q8IVH2 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
FOXP4Q8IVH2 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
FOXP4Q8IVH2 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
FOXP4Q8IVH2 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
FOXP4Q8IVH2 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
FOXP4Q8IVH2 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
FOXP4Q8IVH2 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
FOXP4Q8IVH2 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
FOXP4Q8IVH2 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
FOXP4Q8IVH2 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
FOXP4Q8IVH2 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
FOXP4Q8IVH2 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
FOXP4Q8IVH2 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
FOXP4Q8IVH2 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
FOXP4Q8IVH2 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
FOXP4Q8IVH2 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
FOXP4Q8IVH2 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
FOXP4Q8IVH2 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
FOXP4Q8IVH2 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
FOXP4Q8IVH2 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
FOXP4Q8IVH2 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
FOXP4Q8IVH2 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
FOXP4Q8IVH2 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
FOXP4Q8IVH2 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
FOXP4Q8IVH2 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
FOXP4Q8IVH2 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
FOXP4Q8IVH2 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
FOXP4Q8IVH2 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
FOXP4Q8IVH2 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
FOXP4Q8IVH2 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
FOXP4Q8IVH2 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
FOXP4Q8IVH2 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
FOXP4Q8IVH2 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
FOXP4Q8IVH2 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms