Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV01

SYT12, Synaptotagmin-12, humanhuman

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT12Q8IV01 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SYT12Q8IV01 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SYT12Q8IV01 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SYT12Q8IV01 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SYT12Q8IV01 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SYT12Q8IV01 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SYT12Q8IV01 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYT12Q8IV01 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYT12Q8IV01 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYT12Q8IV01 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYT12Q8IV01 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYT12Q8IV01 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SYT12Q8IV01 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SYT12Q8IV01 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SYT12Q8IV01 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SYT12Q8IV01 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SYT12Q8IV01 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SYT12Q8IV01 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SYT12Q8IV01 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SYT12Q8IV01 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SYT12Q8IV01 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SYT12Q8IV01 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SYT12Q8IV01 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SYT12Q8IV01 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYT12Q8IV01 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYT12Q8IV01 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYT12Q8IV01 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYT12Q8IV01 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SYT12Q8IV01 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYT12Q8IV01 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYT12Q8IV01 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYT12Q8IV01 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYT12Q8IV01 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYT12Q8IV01 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SYT12Q8IV01 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SYT12Q8IV01 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
SYT12Q8IV01 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SYT12Q8IV01 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SYT12Q8IV01 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SYT12Q8IV01 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SYT12Q8IV01 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SYT12Q8IV01 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SYT12Q8IV01 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SYT12Q8IV01 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SYT12Q8IV01 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SYT12Q8IV01 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SYT12Q8IV01 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SYT12Q8IV01 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SYT12Q8IV01 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYT12Q8IV01 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYT12Q8IV01 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SYT12Q8IV01 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SYT12Q8IV01 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SYT12Q8IV01 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SYT12Q8IV01 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SYT12Q8IV01 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SYT12Q8IV01 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SYT12Q8IV01 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SYT12Q8IV01 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SYT12Q8IV01 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SYT12Q8IV01 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SYT12Q8IV01 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SYT12Q8IV01 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SYT12Q8IV01 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SYT12Q8IV01 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SYT12Q8IV01 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SYT12Q8IV01 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SYT12Q8IV01 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYT12Q8IV01 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SYT12Q8IV01 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYT12Q8IV01 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYT12Q8IV01 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYT12Q8IV01 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYT12Q8IV01 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYT12Q8IV01 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYT12Q8IV01 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYT12Q8IV01 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYT12Q8IV01 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYT12Q8IV01 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYT12Q8IV01 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SYT12Q8IV01 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYT12Q8IV01 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYT12Q8IV01 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYT12Q8IV01 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYT12Q8IV01 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYT12Q8IV01 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYT12Q8IV01 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SYT12Q8IV01 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYT12Q8IV01 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYT12Q8IV01 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYT12Q8IV01 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYT12Q8IV01 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SYT12Q8IV01 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SYT12Q8IV01 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYT12Q8IV01 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYT12Q8IV01 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYT12Q8IV01 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYT12Q8IV01 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYT12Q8IV01 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYT12Q8IV01 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 138.5 ms