Protein–RNA interactions for Protein: Q86TU7

SETD3, Histone-lysine N-methyltransferase setd3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD3Q86TU7 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SETD3Q86TU7 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SETD3Q86TU7 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SETD3Q86TU7 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SETD3Q86TU7 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SETD3Q86TU7 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SETD3Q86TU7 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SETD3Q86TU7 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SETD3Q86TU7 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SETD3Q86TU7 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SETD3Q86TU7 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SETD3Q86TU7 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SETD3Q86TU7 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SETD3Q86TU7 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SETD3Q86TU7 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SETD3Q86TU7 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SETD3Q86TU7 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SETD3Q86TU7 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SETD3Q86TU7 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SETD3Q86TU7 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SETD3Q86TU7 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SETD3Q86TU7 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SETD3Q86TU7 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SETD3Q86TU7 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SETD3Q86TU7 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SETD3Q86TU7 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SETD3Q86TU7 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
SETD3Q86TU7 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SETD3Q86TU7 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SETD3Q86TU7 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SETD3Q86TU7 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SETD3Q86TU7 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SETD3Q86TU7 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SETD3Q86TU7 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SETD3Q86TU7 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SETD3Q86TU7 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SETD3Q86TU7 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SETD3Q86TU7 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SETD3Q86TU7 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SETD3Q86TU7 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SETD3Q86TU7 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SETD3Q86TU7 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SETD3Q86TU7 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SETD3Q86TU7 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SETD3Q86TU7 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SETD3Q86TU7 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SETD3Q86TU7 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SETD3Q86TU7 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SETD3Q86TU7 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SETD3Q86TU7 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SETD3Q86TU7 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SETD3Q86TU7 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SETD3Q86TU7 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SETD3Q86TU7 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SETD3Q86TU7 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SETD3Q86TU7 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SETD3Q86TU7 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SETD3Q86TU7 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SETD3Q86TU7 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SETD3Q86TU7 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SETD3Q86TU7 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SETD3Q86TU7 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SETD3Q86TU7 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SETD3Q86TU7 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SETD3Q86TU7 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SETD3Q86TU7 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SETD3Q86TU7 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SETD3Q86TU7 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SETD3Q86TU7 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SETD3Q86TU7 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SETD3Q86TU7 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SETD3Q86TU7 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SETD3Q86TU7 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SETD3Q86TU7 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SETD3Q86TU7 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SETD3Q86TU7 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SETD3Q86TU7 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SETD3Q86TU7 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SETD3Q86TU7 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SETD3Q86TU7 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SETD3Q86TU7 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SETD3Q86TU7 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SETD3Q86TU7 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SETD3Q86TU7 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SETD3Q86TU7 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SETD3Q86TU7 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SETD3Q86TU7 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SETD3Q86TU7 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SETD3Q86TU7 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SETD3Q86TU7 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SETD3Q86TU7 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SETD3Q86TU7 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SETD3Q86TU7 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SETD3Q86TU7 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SETD3Q86TU7 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SETD3Q86TU7 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SETD3Q86TU7 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SETD3Q86TU7 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SETD3Q86TU7 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SETD3Q86TU7 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms