Protein–RNA interactions for Protein: Q86SJ6

DSG4, Desmoglein-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG4Q86SJ6 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DSG4Q86SJ6 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DSG4Q86SJ6 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DSG4Q86SJ6 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
DSG4Q86SJ6 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DSG4Q86SJ6 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DSG4Q86SJ6 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DSG4Q86SJ6 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DSG4Q86SJ6 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DSG4Q86SJ6 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DSG4Q86SJ6 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DSG4Q86SJ6 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DSG4Q86SJ6 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DSG4Q86SJ6 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DSG4Q86SJ6 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DSG4Q86SJ6 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DSG4Q86SJ6 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DSG4Q86SJ6 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
DSG4Q86SJ6 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DSG4Q86SJ6 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DSG4Q86SJ6 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
DSG4Q86SJ6 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DSG4Q86SJ6 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DSG4Q86SJ6 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DSG4Q86SJ6 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
DSG4Q86SJ6 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DSG4Q86SJ6 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DSG4Q86SJ6 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DSG4Q86SJ6 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DSG4Q86SJ6 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DSG4Q86SJ6 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DSG4Q86SJ6 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DSG4Q86SJ6 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DSG4Q86SJ6 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DSG4Q86SJ6 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DSG4Q86SJ6 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DSG4Q86SJ6 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DSG4Q86SJ6 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DSG4Q86SJ6 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DSG4Q86SJ6 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DSG4Q86SJ6 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DSG4Q86SJ6 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DSG4Q86SJ6 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DSG4Q86SJ6 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
DSG4Q86SJ6 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DSG4Q86SJ6 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
DSG4Q86SJ6 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DSG4Q86SJ6 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DSG4Q86SJ6 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DSG4Q86SJ6 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
DSG4Q86SJ6 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DSG4Q86SJ6 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DSG4Q86SJ6 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
DSG4Q86SJ6 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
DSG4Q86SJ6 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
DSG4Q86SJ6 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
DSG4Q86SJ6 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
DSG4Q86SJ6 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DSG4Q86SJ6 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DSG4Q86SJ6 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DSG4Q86SJ6 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DSG4Q86SJ6 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DSG4Q86SJ6 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DSG4Q86SJ6 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DSG4Q86SJ6 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DSG4Q86SJ6 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DSG4Q86SJ6 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DSG4Q86SJ6 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
DSG4Q86SJ6 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DSG4Q86SJ6 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
DSG4Q86SJ6 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DSG4Q86SJ6 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DSG4Q86SJ6 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DSG4Q86SJ6 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DSG4Q86SJ6 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
DSG4Q86SJ6 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DSG4Q86SJ6 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DSG4Q86SJ6 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DSG4Q86SJ6 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DSG4Q86SJ6 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DSG4Q86SJ6 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DSG4Q86SJ6 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DSG4Q86SJ6 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DSG4Q86SJ6 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DSG4Q86SJ6 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DSG4Q86SJ6 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DSG4Q86SJ6 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DSG4Q86SJ6 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DSG4Q86SJ6 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DSG4Q86SJ6 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DSG4Q86SJ6 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DSG4Q86SJ6 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DSG4Q86SJ6 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DSG4Q86SJ6 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DSG4Q86SJ6 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
DSG4Q86SJ6 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
DSG4Q86SJ6 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DSG4Q86SJ6 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DSG4Q86SJ6 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DSG4Q86SJ6 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms