Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z6K3

PTAR1, Protein prenyltransferase alpha subunit repeat-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTAR1Q7Z6K3 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTAR1Q7Z6K3 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTAR1Q7Z6K3 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PTAR1Q7Z6K3 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PTAR1Q7Z6K3 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTAR1Q7Z6K3 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTAR1Q7Z6K3 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTAR1Q7Z6K3 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTAR1Q7Z6K3 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTAR1Q7Z6K3 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTAR1Q7Z6K3 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTAR1Q7Z6K3 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTAR1Q7Z6K3 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTAR1Q7Z6K3 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PTAR1Q7Z6K3 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTAR1Q7Z6K3 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTAR1Q7Z6K3 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTAR1Q7Z6K3 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTAR1Q7Z6K3 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PTAR1Q7Z6K3 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTAR1Q7Z6K3 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTAR1Q7Z6K3 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTAR1Q7Z6K3 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTAR1Q7Z6K3 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTAR1Q7Z6K3 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTAR1Q7Z6K3 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTAR1Q7Z6K3 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTAR1Q7Z6K3 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTAR1Q7Z6K3 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTAR1Q7Z6K3 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTAR1Q7Z6K3 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTAR1Q7Z6K3 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTAR1Q7Z6K3 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTAR1Q7Z6K3 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PTAR1Q7Z6K3 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTAR1Q7Z6K3 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTAR1Q7Z6K3 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PTAR1Q7Z6K3 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTAR1Q7Z6K3 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PTAR1Q7Z6K3 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PTAR1Q7Z6K3 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTAR1Q7Z6K3 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTAR1Q7Z6K3 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTAR1Q7Z6K3 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTAR1Q7Z6K3 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTAR1Q7Z6K3 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTAR1Q7Z6K3 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTAR1Q7Z6K3 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTAR1Q7Z6K3 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTAR1Q7Z6K3 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTAR1Q7Z6K3 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTAR1Q7Z6K3 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTAR1Q7Z6K3 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTAR1Q7Z6K3 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PTAR1Q7Z6K3 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTAR1Q7Z6K3 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTAR1Q7Z6K3 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTAR1Q7Z6K3 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTAR1Q7Z6K3 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTAR1Q7Z6K3 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTAR1Q7Z6K3 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTAR1Q7Z6K3 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PTAR1Q7Z6K3 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTAR1Q7Z6K3 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTAR1Q7Z6K3 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTAR1Q7Z6K3 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTAR1Q7Z6K3 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTAR1Q7Z6K3 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTAR1Q7Z6K3 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTAR1Q7Z6K3 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTAR1Q7Z6K3 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTAR1Q7Z6K3 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTAR1Q7Z6K3 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTAR1Q7Z6K3 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTAR1Q7Z6K3 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTAR1Q7Z6K3 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PTAR1Q7Z6K3 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTAR1Q7Z6K3 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTAR1Q7Z6K3 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTAR1Q7Z6K3 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PTAR1Q7Z6K3 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTAR1Q7Z6K3 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTAR1Q7Z6K3 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTAR1Q7Z6K3 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTAR1Q7Z6K3 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTAR1Q7Z6K3 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTAR1Q7Z6K3 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTAR1Q7Z6K3 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTAR1Q7Z6K3 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTAR1Q7Z6K3 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTAR1Q7Z6K3 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTAR1Q7Z6K3 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTAR1Q7Z6K3 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTAR1Q7Z6K3 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTAR1Q7Z6K3 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTAR1Q7Z6K3 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTAR1Q7Z6K3 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTAR1Q7Z6K3 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTAR1Q7Z6K3 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTAR1Q7Z6K3 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.6 ms