Protein–RNA interactions for Protein: Q7L1S5

CHST9, Carbohydrate sulfotransferase 9, humanhuman

Predictions only

Length 443 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST9Q7L1S5 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHST9Q7L1S5 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHST9Q7L1S5 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHST9Q7L1S5 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHST9Q7L1S5 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHST9Q7L1S5 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHST9Q7L1S5 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHST9Q7L1S5 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHST9Q7L1S5 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHST9Q7L1S5 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHST9Q7L1S5 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHST9Q7L1S5 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CHST9Q7L1S5 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHST9Q7L1S5 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHST9Q7L1S5 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHST9Q7L1S5 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHST9Q7L1S5 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHST9Q7L1S5 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHST9Q7L1S5 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CHST9Q7L1S5 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHST9Q7L1S5 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHST9Q7L1S5 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHST9Q7L1S5 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHST9Q7L1S5 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHST9Q7L1S5 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHST9Q7L1S5 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHST9Q7L1S5 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHST9Q7L1S5 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHST9Q7L1S5 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHST9Q7L1S5 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHST9Q7L1S5 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHST9Q7L1S5 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CHST9Q7L1S5 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHST9Q7L1S5 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CHST9Q7L1S5 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CHST9Q7L1S5 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CHST9Q7L1S5 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CHST9Q7L1S5 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHST9Q7L1S5 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHST9Q7L1S5 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHST9Q7L1S5 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHST9Q7L1S5 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHST9Q7L1S5 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHST9Q7L1S5 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHST9Q7L1S5 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHST9Q7L1S5 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHST9Q7L1S5 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHST9Q7L1S5 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHST9Q7L1S5 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHST9Q7L1S5 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CHST9Q7L1S5 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHST9Q7L1S5 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHST9Q7L1S5 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CHST9Q7L1S5 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHST9Q7L1S5 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHST9Q7L1S5 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHST9Q7L1S5 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHST9Q7L1S5 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHST9Q7L1S5 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHST9Q7L1S5 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHST9Q7L1S5 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHST9Q7L1S5 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHST9Q7L1S5 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHST9Q7L1S5 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHST9Q7L1S5 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHST9Q7L1S5 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHST9Q7L1S5 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHST9Q7L1S5 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CHST9Q7L1S5 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHST9Q7L1S5 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHST9Q7L1S5 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHST9Q7L1S5 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHST9Q7L1S5 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHST9Q7L1S5 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHST9Q7L1S5 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CHST9Q7L1S5 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHST9Q7L1S5 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHST9Q7L1S5 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHST9Q7L1S5 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHST9Q7L1S5 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHST9Q7L1S5 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHST9Q7L1S5 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHST9Q7L1S5 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHST9Q7L1S5 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHST9Q7L1S5 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHST9Q7L1S5 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHST9Q7L1S5 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHST9Q7L1S5 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHST9Q7L1S5 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHST9Q7L1S5 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHST9Q7L1S5 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHST9Q7L1S5 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHST9Q7L1S5 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHST9Q7L1S5 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHST9Q7L1S5 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHST9Q7L1S5 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHST9Q7L1S5 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHST9Q7L1S5 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHST9Q7L1S5 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHST9Q7L1S5 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms