Protein–RNA interactions for Protein: Q7KZF4

SND1, Staphylococcal nuclease domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 910 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SND1Q7KZF4 TFPI-201ENST00000233156 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.471e-7■■■■■ 28.2
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SND1Q7KZF4 TPP1-202ENST00000428886 841 ntTSL 213.4□□□□□ -0.267e-9■■■■■ 28.2
SND1Q7KZF4 TPP1-216ENST00000534644 636 ntTSL 410.63□□□□□ -0.717e-9■■■■■ 28.2
SND1Q7KZF4 TPP1-208ENST00000528571 561 ntTSL 48.02□□□□□ -1.137e-9■■■■■ 28.2
SND1Q7KZF4 ATP6AP2-229ENST00000637930 1136 ntTSL 59.54□□□□□ -0.881e-8■■■■■ 28.2
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SND1Q7KZF4 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.373e-9■■■■■ 28.1
SND1Q7KZF4 CCPG1-210ENST00000568592 702 ntTSL 35.18□□□□□ -1.584e-8■■■■■ 28.1
SND1Q7KZF4 TFPI-208ENST00000435414 687 ntTSL 56.56□□□□□ -1.362e-7■■■■■ 28.1
SND1Q7KZF4 GLB1-206ENST00000438227 569 ntTSL 46.36□□□□□ -1.392e-7■■■■■ 28.1
SND1Q7KZF4 LGMN-213ENST00000556790 352 ntTSL 26.49□□□□□ -1.372e-8■■■■■ 28.1
SND1Q7KZF4 SERPINA7-202ENST00000372563 1600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.474e-10■■■■■ 28.1
SND1Q7KZF4 SERPINA7-201ENST00000327674 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.574e-10■■■■■ 28.1
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SND1Q7KZF4 STT3A-205ENST00000525946 1383 ntTSL 27.7□□□□□ -1.182e-9■■■■■ 28.1
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SND1Q7KZF4 SLC1A4-202ENST00000471551 461 ntTSL 413.48□□□□□ -0.251e-8■■■■■ 28
SND1Q7KZF4 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.912e-7■■■■■ 28
SND1Q7KZF4 CLN3-217ENST00000565354 759 ntTSL 517.91■□□□□ 0.469e-9■■■■■ 28
SND1Q7KZF4 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.322e-7■■■■■ 28
SND1Q7KZF4 TAPBPL-208ENST00000545700 2344 ntTSL 216.99■□□□□ 0.312e-7■■■■■ 28
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SND1Q7KZF4 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.192e-7■■■■■ 28
SND1Q7KZF4 TAPBPL-202ENST00000539384 1611 ntTSL 515.39■□□□□ 0.052e-7■■■■■ 28
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SND1Q7KZF4 ACP2-203ENST00000524769 727 ntTSL 314.4□□□□□ -0.12e-7■■■■■ 28
SND1Q7KZF4 CDH1-204ENST00000562118 952 ntTSL 213.89□□□□□ -0.192e-7■■■■■ 28
SND1Q7KZF4 MET-201ENST00000318493 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.342e-7■■■■■ 28
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SND1Q7KZF4 MDH1-203ENST00000409908 700 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.621e-8■■■■■ 28
SND1Q7KZF4 MDH1-202ENST00000409476 808 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.621e-8■■■■■ 28
SND1Q7KZF4 MDH1-201ENST00000233114 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.681e-8■■■■■ 28
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SND1Q7KZF4 MDH1-215ENST00000539945 1443 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.81e-8■■■■■ 28
SND1Q7KZF4 AC138894.1-205ENST00000637378 1112 ntAPPRIS P1 TSL 59.96□□□□□ -0.829e-9■■■■■ 28
SND1Q7KZF4 MET-202ENST00000397752 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.842e-7■■■■■ 28
SND1Q7KZF4 TGFB1-203ENST00000598758 559 ntTSL 59.68□□□□□ -0.862e-7■■■■■ 28
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SND1Q7KZF4 PSMB3-209ENST00000614132 426 ntTSL 24.87□□□□□ -1.634e-14■■■■■ 28
SND1Q7KZF4 NDUFA4-202ENST00000463308 288 ntTSL 24.45□□□□□ -1.74e-10■■■■■ 28
SND1Q7KZF4 SRPRB-205ENST00000494297 555 ntTSL 25.57□□□□□ -1.525e-8■■■■■ 28
SND1Q7KZF4 TCN1-201ENST00000257264 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.138e-14■■■■■ 28
SND1Q7KZF4 TCN1-203ENST00000532419 745 ntTSL 56.47□□□□□ -1.378e-14■■■■■ 28
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SND1Q7KZF4 ALB-209ENST00000503124 1741 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.281e-323■■■■■ 28
SND1Q7KZF4 ALB-201ENST00000295897 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.291e-323■■■■■ 28
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SND1Q7KZF4 ALB-202ENST00000401494 1659 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.411e-323■■■■■ 28
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SND1Q7KZF4 CCDC134-202ENST00000402061 525 ntTSL 2 BASIC8.79□□□□□ -12e-6■■■■■ 27.9
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SND1Q7KZF4 AFP-206ENST00000514279 693 ntTSL 26.33□□□□□ -1.41e-323■■■■■ 27.9
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SND1Q7KZF4 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.892e-10■■■■■ 27.8
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SND1Q7KZF4 H3F3A-201ENST00000366813 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.652e-10■■■■■ 27.8
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SND1Q7KZF4 IFI30-202ENST00000597802 411 ntTSL 310.85□□□□□ -0.674e-10■■■■■ 27.8
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SND1Q7KZF4 SERPIND1-201ENST00000215727 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.82e-16■■■■■ 27.8
SND1Q7KZF4 AMN-202ENST00000541086 2269 ntTSL 224.79■■□□□ 1.561e-7■■■■■ 27.8
SND1Q7KZF4 ATP6AP2-222ENST00000637140 587 ntTSL 26.15□□□□□ -1.422e-7■■■■■ 27.7
SND1Q7KZF4 VCAN-206ENST00000505615 810 ntTSL 57.54□□□□□ -1.22e-6■■■■■ 27.7
SND1Q7KZF4 REEP6-204ENST00000591735 1026 ntTSL 222.72■■□□□ 1.231e-6■■■■■ 27.7
SND1Q7KZF4 GANAB-210ENST00000531563 414 ntTSL 28.41□□□□□ -1.067e-26■■■■■ 27.7
SND1Q7KZF4 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.443e-7■■■■■ 27.7
SND1Q7KZF4 COL2A1-201ENST00000337299 4257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 03e-7■■■■■ 27.7
SND1Q7KZF4 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.145e-29■■■■■ 27.7
SND1Q7KZF4 F2-205ENST00000530231 1849 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.025e-29■■■■■ 27.7
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SND1Q7KZF4 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21e-7■■■■■ 27.7
SND1Q7KZF4 PEF1-204ENST00000472443 687 ntTSL 315.9■□□□□ 0.141e-7■■■■■ 27.7
SND1Q7KZF4 PEF1-206ENST00000489164 865 ntTSL 515.9■□□□□ 0.141e-7■■■■■ 27.7
SND1Q7KZF4 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.051e-7■■■■■ 27.7
SND1Q7KZF4 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.011e-7■■■■■ 27.7
SND1Q7KZF4 NUP160-201ENST00000378460 5376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.021e-7■■■■■ 27.7
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