RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591735.2

REEP6-204, Transcript of receptor accessory protein 6, humanhuman

TSL 2

Gene REEP6, Length 1,026 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REEP6-204ENST00000591735 NISCHQ9Y2I1 1504 aa54.07■■■■■ 6.25
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REEP6-204ENST00000591735 ABCC9O60706 1549 aa47.55■■■■■ 5.2
REEP6-204ENST00000591735 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa45.53■■■■■ 4.88
REEP6-204ENST00000591735 NACADO15069 1562 aa45.37■■■■■ 4.85
REEP6-204ENST00000591735 DCAF8L2P0C7V8 631 aa45.35■■■■■ 4.85
REEP6-204ENST00000591735 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP44.98■■■■■ 4.79
REEP6-204ENST00000591735 MYO15BQ96JP2 1530 aa44.91■■■■■ 4.78
REEP6-204ENST00000591735 UNC13AQ9UPW8 1703 aa44.66■■■■■ 4.74
REEP6-204ENST00000591735 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa44.65■■■■■ 4.74
REEP6-204ENST00000591735 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP44.36■■■■■ 4.69
REEP6-204ENST00000591735 BICRAQ9NZM4 1560 aa44.22■■■■■ 4.67
REEP6-204ENST00000591735 SCRIBQ14160 1630 aa44.08■■■■■ 4.65
REEP6-204ENST00000591735 DNAJC5BQ9UF47 199 aa43.89■■■■■ 4.62
REEP6-204ENST00000591735 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa43.57■■■■■ 4.56
REEP6-204ENST00000591735 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP43.06■■■■■ 4.48
REEP6-204ENST00000591735 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa42.99■■■■■ 4.47
REEP6-204ENST00000591735 CECR2Q9BXF3 1484 aa42.7■■■■■ 4.43
REEP6-204ENST00000591735 SMARCA4P51532 1647 aa42.08■■■■■ 4.33
REEP6-204ENST00000591735 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP41.93■■■■■ 4.3
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REEP6-204ENST00000591735 NCAPD3P42695 1498 aa41.84■■■■■ 4.29
REEP6-204ENST00000591735 SMARCA2P51531 1590 aa41.79■■■■■ 4.28
REEP6-204ENST00000591735 MROH2BQ7Z745 1585 aa41.72■■■■■ 4.27
REEP6-204ENST00000591735 HMGXB3Q12766 1538 aa41.65■■■■■ 4.26
REEP6-204ENST00000591735 PEG3Q9GZU2 1588 aa41.59■■■■■ 4.25
REEP6-204ENST00000591735 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP41.53■■■■■ 4.24
REEP6-204ENST00000591735 WIZO95785 1651 aa41.31■■■■■ 4.2
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REEP6-204ENST00000591735 NESP48681 1621 aa41.07■■■■■ 4.17
REEP6-204ENST00000591735 ERCC6Q03468 1493 aa40.97■■■■■ 4.15
REEP6-204ENST00000591735 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa40.83■■■■■ 4.13
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REEP6-204ENST00000591735 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa40.62■■■■■ 4.09
REEP6-204ENST00000591735 CADPSQ9ULU8 1353 aa40.61■■■■■ 4.09
REEP6-204ENST00000591735 CUX2O14529 1486 aa40.58■■■■■ 4.09
REEP6-204ENST00000591735 PDS5BQ9NTI5 1447 aa40.52■■■■■ 4.08
REEP6-204ENST00000591735 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP40.5■■■■■ 4.07
REEP6-204ENST00000591735 CFTRP13569 1480 aa40.32■■■■■ 4.05
REEP6-204ENST00000591735 CCDC88BA6NC98 1476 aa40.29■■■■■ 4.04
REEP6-204ENST00000591735 FANCD2Q9BXW9 1451 aa40.21■■■■■ 4.03
REEP6-204ENST00000591735 MRC2Q9UBG0 1479 aa40.19■■■■■ 4.03
REEP6-204ENST00000591735 CEP164Q9UPV0 1460 aa40.19■■■■■ 4.02
REEP6-204ENST00000591735 PRDM2Q13029 1718 aa40.13■■■■■ 4.02
REEP6-204ENST00000591735 WDR62O43379 1518 aa40.07■■■■■ 4.01
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REEP6-204ENST00000591735 TOPBP1Q92547 1522 aa39.54■■■■□ 3.92
REEP6-204ENST00000591735 DNMBPQ6XZF7 1577 aa39.47■■■■□ 3.91
REEP6-204ENST00000591735 ABCC8Q09428 1581 aa39.42■■■■□ 3.9
REEP6-204ENST00000591735 IFT140Q96RY7 1462 aa39.32■■■■□ 3.89
REEP6-204ENST00000591735 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP39.25■■■■□ 3.87
REEP6-204ENST00000591735 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP39.18■■■■□ 3.86
REEP6-204ENST00000591735 CUX1P39880 1505 aa39.16■■■■□ 3.86
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REEP6-204ENST00000591735 FGD5Q6ZNL6 1462 aa39.06■■■■□ 3.84
REEP6-204ENST00000591735 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa39.05■■■■□ 3.84
REEP6-204ENST00000591735 SOGA1O94964 1423 aa38.98■■■■□ 3.83
REEP6-204ENST00000591735 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP38.98■■■■□ 3.83
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REEP6-204ENST00000591735 OSCARQ8IYS5 282 aa38.82■■■■□ 3.8
REEP6-204ENST00000591735 WDR97A6NE52 1622 aa38.81■■■■□ 3.8
REEP6-204ENST00000591735 SYNJ1O43426 1573 aa38.75■■■■□ 3.79
REEP6-204ENST00000591735 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP38.74■■■■□ 3.79
REEP6-204ENST00000591735 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa38.74■■■■□ 3.79
REEP6-204ENST00000591735 CHD1O14646 1710 aa38.73■■■■□ 3.79
REEP6-204ENST00000591735 TOP2BQ02880 1626 aa38.72■■■■□ 3.79
REEP6-204ENST00000591735 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa38.62■■■■□ 3.77
REEP6-204ENST00000591735 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa38.61■■■■□ 3.77
REEP6-204ENST00000591735 PBRM1Q86U86 1689 aa38.59■■■■□ 3.77
REEP6-204ENST00000591735 GRIN2BQ13224 1484 aa38.56■■■■□ 3.76
REEP6-204ENST00000591735 FBLN2P98095 1184 aa38.56■■■■□ 3.76
REEP6-204ENST00000591735 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa38.56■■■■□ 3.76
REEP6-204ENST00000591735 GAPVD1Q14C86 1478 aa38.54■■■■□ 3.76
REEP6-204ENST00000591735 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP38.48■■■■□ 3.75
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REEP6-204ENST00000591735 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa38.38■■■■□ 3.73
REEP6-204ENST00000591735 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa38.38■■■■□ 3.73
REEP6-204ENST00000591735 TRIM41Q8WV44 630 aa38.37■■■■□ 3.73
REEP6-204ENST00000591735 SYNJ2O15056 1496 aa38.35■■■■□ 3.73
REEP6-204ENST00000591735 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP38.35■■■■□ 3.73
REEP6-204ENST00000591735 ARHGEF11O15085 1522 aa38.29■■■■□ 3.72
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REEP6-204ENST00000591735 ERICH3Q5RHP9 1530 aa38.15■■■■□ 3.7
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REEP6-204ENST00000591735 CYB5RLQ6IPT4 315 aa37.92■■■■□ 3.66
REEP6-204ENST00000591735 NUP160Q12769 1436 aa37.91■■■■□ 3.66
REEP6-204ENST00000591735 IGF1RP08069 1367 aa37.8■■■■□ 3.64
REEP6-204ENST00000591735 CUL7Q14999 1698 aa37.79■■■■□ 3.64
REEP6-204ENST00000591735 ERCC6L2Q5T890 1561 aa37.73■■■■□ 3.63
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REEP6-204ENST00000591735 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa37.67■■■■□ 3.62
REEP6-204ENST00000591735 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa37.59■■■■□ 3.61
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