Protein–RNA interactions for Protein: Q6UY09

CEACAM20, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 20, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEACAM20Q6UY09 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CEACAM20Q6UY09 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CEACAM20Q6UY09 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CEACAM20Q6UY09 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CEACAM20Q6UY09 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CEACAM20Q6UY09 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CEACAM20Q6UY09 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CEACAM20Q6UY09 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CEACAM20Q6UY09 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CEACAM20Q6UY09 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CEACAM20Q6UY09 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CEACAM20Q6UY09 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CEACAM20Q6UY09 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CEACAM20Q6UY09 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CEACAM20Q6UY09 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CEACAM20Q6UY09 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CEACAM20Q6UY09 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CEACAM20Q6UY09 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CEACAM20Q6UY09 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CEACAM20Q6UY09 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CEACAM20Q6UY09 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CEACAM20Q6UY09 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CEACAM20Q6UY09 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CEACAM20Q6UY09 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CEACAM20Q6UY09 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CEACAM20Q6UY09 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CEACAM20Q6UY09 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CEACAM20Q6UY09 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CEACAM20Q6UY09 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CEACAM20Q6UY09 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CEACAM20Q6UY09 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CEACAM20Q6UY09 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CEACAM20Q6UY09 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CEACAM20Q6UY09 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CEACAM20Q6UY09 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CEACAM20Q6UY09 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CEACAM20Q6UY09 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CEACAM20Q6UY09 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CEACAM20Q6UY09 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CEACAM20Q6UY09 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CEACAM20Q6UY09 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CEACAM20Q6UY09 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CEACAM20Q6UY09 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CEACAM20Q6UY09 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CEACAM20Q6UY09 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CEACAM20Q6UY09 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CEACAM20Q6UY09 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CEACAM20Q6UY09 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CEACAM20Q6UY09 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CEACAM20Q6UY09 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CEACAM20Q6UY09 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CEACAM20Q6UY09 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CEACAM20Q6UY09 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CEACAM20Q6UY09 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CEACAM20Q6UY09 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CEACAM20Q6UY09 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CEACAM20Q6UY09 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CEACAM20Q6UY09 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CEACAM20Q6UY09 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CEACAM20Q6UY09 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CEACAM20Q6UY09 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CEACAM20Q6UY09 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CEACAM20Q6UY09 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CEACAM20Q6UY09 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CEACAM20Q6UY09 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CEACAM20Q6UY09 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CEACAM20Q6UY09 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CEACAM20Q6UY09 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CEACAM20Q6UY09 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CEACAM20Q6UY09 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CEACAM20Q6UY09 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CEACAM20Q6UY09 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CEACAM20Q6UY09 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CEACAM20Q6UY09 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CEACAM20Q6UY09 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CEACAM20Q6UY09 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CEACAM20Q6UY09 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CEACAM20Q6UY09 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CEACAM20Q6UY09 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CEACAM20Q6UY09 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CEACAM20Q6UY09 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CEACAM20Q6UY09 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CEACAM20Q6UY09 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CEACAM20Q6UY09 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CEACAM20Q6UY09 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CEACAM20Q6UY09 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CEACAM20Q6UY09 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CEACAM20Q6UY09 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CEACAM20Q6UY09 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CEACAM20Q6UY09 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CEACAM20Q6UY09 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CEACAM20Q6UY09 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CEACAM20Q6UY09 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CEACAM20Q6UY09 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CEACAM20Q6UY09 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CEACAM20Q6UY09 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CEACAM20Q6UY09 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CEACAM20Q6UY09 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CEACAM20Q6UY09 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CEACAM20Q6UY09 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms