Protein–RNA interactions for Protein: Q6UVM3

KCNT2, Potassium channel subfamily T member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNT2Q6UVM3 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC26.24■■□□□ 1.79
KCNT2Q6UVM3 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
KCNT2Q6UVM3 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
KCNT2Q6UVM3 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
KCNT2Q6UVM3 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
KCNT2Q6UVM3 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
KCNT2Q6UVM3 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
KCNT2Q6UVM3 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
KCNT2Q6UVM3 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
KCNT2Q6UVM3 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
KCNT2Q6UVM3 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
KCNT2Q6UVM3 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
KCNT2Q6UVM3 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
KCNT2Q6UVM3 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
KCNT2Q6UVM3 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
KCNT2Q6UVM3 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
KCNT2Q6UVM3 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
KCNT2Q6UVM3 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
KCNT2Q6UVM3 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
KCNT2Q6UVM3 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
KCNT2Q6UVM3 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
KCNT2Q6UVM3 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
KCNT2Q6UVM3 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
KCNT2Q6UVM3 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
KCNT2Q6UVM3 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
KCNT2Q6UVM3 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
KCNT2Q6UVM3 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
KCNT2Q6UVM3 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
KCNT2Q6UVM3 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
KCNT2Q6UVM3 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
KCNT2Q6UVM3 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
KCNT2Q6UVM3 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
KCNT2Q6UVM3 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
KCNT2Q6UVM3 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
KCNT2Q6UVM3 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
KCNT2Q6UVM3 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
KCNT2Q6UVM3 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
KCNT2Q6UVM3 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KCNT2Q6UVM3 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
KCNT2Q6UVM3 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
KCNT2Q6UVM3 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
KCNT2Q6UVM3 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
KCNT2Q6UVM3 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
KCNT2Q6UVM3 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
KCNT2Q6UVM3 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KCNT2Q6UVM3 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KCNT2Q6UVM3 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KCNT2Q6UVM3 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KCNT2Q6UVM3 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
KCNT2Q6UVM3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KCNT2Q6UVM3 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KCNT2Q6UVM3 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
KCNT2Q6UVM3 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
KCNT2Q6UVM3 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
KCNT2Q6UVM3 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KCNT2Q6UVM3 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
KCNT2Q6UVM3 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
KCNT2Q6UVM3 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
KCNT2Q6UVM3 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
KCNT2Q6UVM3 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
KCNT2Q6UVM3 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
KCNT2Q6UVM3 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KCNT2Q6UVM3 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
KCNT2Q6UVM3 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
KCNT2Q6UVM3 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KCNT2Q6UVM3 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KCNT2Q6UVM3 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KCNT2Q6UVM3 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KCNT2Q6UVM3 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KCNT2Q6UVM3 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KCNT2Q6UVM3 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KCNT2Q6UVM3 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KCNT2Q6UVM3 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KCNT2Q6UVM3 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KCNT2Q6UVM3 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KCNT2Q6UVM3 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KCNT2Q6UVM3 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KCNT2Q6UVM3 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KCNT2Q6UVM3 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KCNT2Q6UVM3 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KCNT2Q6UVM3 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
KCNT2Q6UVM3 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KCNT2Q6UVM3 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KCNT2Q6UVM3 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KCNT2Q6UVM3 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KCNT2Q6UVM3 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KCNT2Q6UVM3 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KCNT2Q6UVM3 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KCNT2Q6UVM3 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KCNT2Q6UVM3 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KCNT2Q6UVM3 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KCNT2Q6UVM3 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KCNT2Q6UVM3 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KCNT2Q6UVM3 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
KCNT2Q6UVM3 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KCNT2Q6UVM3 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KCNT2Q6UVM3 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KCNT2Q6UVM3 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KCNT2Q6UVM3 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KCNT2Q6UVM3 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.5 ms