Protein–RNA interactions for Protein: Q6JBY9

RCSD1, CapZ-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCSD1Q6JBY9 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
RCSD1Q6JBY9 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RCSD1Q6JBY9 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RCSD1Q6JBY9 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RCSD1Q6JBY9 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
RCSD1Q6JBY9 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
RCSD1Q6JBY9 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
RCSD1Q6JBY9 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
RCSD1Q6JBY9 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
RCSD1Q6JBY9 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
RCSD1Q6JBY9 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
RCSD1Q6JBY9 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
RCSD1Q6JBY9 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RCSD1Q6JBY9 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
RCSD1Q6JBY9 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RCSD1Q6JBY9 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RCSD1Q6JBY9 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RCSD1Q6JBY9 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
RCSD1Q6JBY9 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RCSD1Q6JBY9 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RCSD1Q6JBY9 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RCSD1Q6JBY9 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RCSD1Q6JBY9 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RCSD1Q6JBY9 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RCSD1Q6JBY9 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RCSD1Q6JBY9 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RCSD1Q6JBY9 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RCSD1Q6JBY9 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RCSD1Q6JBY9 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RCSD1Q6JBY9 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RCSD1Q6JBY9 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RCSD1Q6JBY9 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RCSD1Q6JBY9 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RCSD1Q6JBY9 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RCSD1Q6JBY9 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RCSD1Q6JBY9 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
RCSD1Q6JBY9 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
RCSD1Q6JBY9 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
RCSD1Q6JBY9 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
RCSD1Q6JBY9 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
RCSD1Q6JBY9 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RCSD1Q6JBY9 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RCSD1Q6JBY9 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RCSD1Q6JBY9 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RCSD1Q6JBY9 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RCSD1Q6JBY9 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RCSD1Q6JBY9 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RCSD1Q6JBY9 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
RCSD1Q6JBY9 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RCSD1Q6JBY9 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RCSD1Q6JBY9 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RCSD1Q6JBY9 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RCSD1Q6JBY9 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
RCSD1Q6JBY9 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RCSD1Q6JBY9 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RCSD1Q6JBY9 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RCSD1Q6JBY9 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RCSD1Q6JBY9 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
RCSD1Q6JBY9 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
RCSD1Q6JBY9 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
RCSD1Q6JBY9 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RCSD1Q6JBY9 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RCSD1Q6JBY9 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RCSD1Q6JBY9 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RCSD1Q6JBY9 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
RCSD1Q6JBY9 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RCSD1Q6JBY9 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
RCSD1Q6JBY9 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RCSD1Q6JBY9 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
RCSD1Q6JBY9 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RCSD1Q6JBY9 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RCSD1Q6JBY9 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RCSD1Q6JBY9 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RCSD1Q6JBY9 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RCSD1Q6JBY9 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RCSD1Q6JBY9 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RCSD1Q6JBY9 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RCSD1Q6JBY9 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RCSD1Q6JBY9 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RCSD1Q6JBY9 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RCSD1Q6JBY9 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RCSD1Q6JBY9 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RCSD1Q6JBY9 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RCSD1Q6JBY9 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RCSD1Q6JBY9 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RCSD1Q6JBY9 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RCSD1Q6JBY9 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RCSD1Q6JBY9 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RCSD1Q6JBY9 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RCSD1Q6JBY9 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RCSD1Q6JBY9 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RCSD1Q6JBY9 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RCSD1Q6JBY9 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RCSD1Q6JBY9 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RCSD1Q6JBY9 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RCSD1Q6JBY9 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RCSD1Q6JBY9 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RCSD1Q6JBY9 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RCSD1Q6JBY9 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RCSD1Q6JBY9 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms